[发明专利]用于减少偏向性的多核苷酸衔接子设计在审
申请号: | 202010338716.8 | 申请日: | 2020-04-26 |
公开(公告)号: | CN111849965A | 公开(公告)日: | 2020-10-30 |
发明(设计)人: | 管胜昔;S·马奎尔 | 申请(专利权)人: | 新英格兰生物实验室公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12P19/34;C12N9/22 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 丁秀云 |
地址: | 美国马*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 减少 偏向 多核苷酸 衔接 设计 | ||
1.组合物,其包含:具有上链和下链的部分双链多核苷酸分子,其中:
(a)所述上链包括第一序列;以及
(b)所述下链包括:
(i)第二序列,其中所述第二序列与所述第一序列互补;
(ii)第三序列,所述第三序列在连接处连接至所述第二序列的3’端并且包含至少4个简并核苷酸的序列;以及
(iii)位点特异性可切割的序列、核苷酸或键,其位于所述第二序列和第三序列之间的所述连接处或附近。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中所述下链在3’端处进一步包括阻断部分。
3.根据权利要求2所述的组合物,其中所述阻断核苷酸防止连接。
4.根据权利要求3所述的组合物,其中所述阻断部分包括选自下列的修饰:3’反向dT、3’C3间隔子、3’氨基dN、3’磷酸化dN、以及二脱氧核苷酸。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的组合物,其中所述上链具有磷酸化的或预腺苷酸化的5’端。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的组合物,其中所述上链和下链是相同寡核苷酸的部分。
7.根据权利要求1-5中任一项所述的组合物,其中所述上链和下链是在不同的寡核苷酸中。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的组合物,其中所述多核苷酸分子是DNA。
9.根据权利要求1-7中任一项所述的组合物,其中所述多核苷酸分子是RNA。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的组合物,其中所述第三序列具有在4-12个核苷酸范围内的长度。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的组合物,其中所述位点特异性可切割的序列包含脱氧尿苷,或其中所述位点特异性可切割的核苷酸是脱氧尿苷。
12.根据权利要求1-10中任一项所述的组合物,其中所述位点特异性可切割的序列包括限制性内切核酸酶切割位点,或由限制性内切核酸酶切割位点组成。
13.根据权利要求1-12中任一项所述的组合物,其中所述位点特异性可切割的序列、核苷酸或键位于所述第二序列和第三序列的连接处。
14.根据权利要求1-12中任一项所述的组合物,其中所述位点特异性可切割的序列、核苷酸或键位于所述第二序列中所述第二序列与第三序列之间的所述连接处的4个核苷酸内。
15.根据权利要求1-14中任一项所述的组合物,其中在所述多核苷酸分子中存在多于一个可切割的核苷酸或序列,其中所述可切割的核苷酸、序列或键中的每一个均位于所述第二序列内所述第二序列与第三序列之间的连接处的8个核苷酸内。
16.组合物,其包含:(i)5’外切核酸酶和(ii)切口内切核酸酶。
17.根据权利要求16所述的组合物,进一步包含一种脱腺苷酶。
18.根据权利要求16或17所述的组合物,进一步包括:(i)切口内切核酸酶和/或(ii)糖基化酶/裂解酶或糖基化酶。
19.根据权利要求16-18中任一项所述的组合物,其中所述5’外切核酸酶是λ5’外切核酸酶。
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