[发明专利]一种眼咽远端型肌病生物标记物和检测方法及其用途有效
申请号: | 202010339754.5 | 申请日: | 2020-04-26 |
公开(公告)号: | CN113549683B | 公开(公告)日: | 2023-10-24 |
发明(设计)人: | 邓健文;于佳希;王朝霞;袁云 | 申请(专利权)人: | 北京大学第一医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 | 代理人: | 尹力 |
地址: | 100034 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 远端 型肌病 生物 标记 检测 方法 及其 用途 | ||
1.GIPC1基因在制备诊断、检测或治疗眼咽远端型肌病的产品中的用途。
2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于,GIPC1基因的5’UTR区域GGC或CGG序列发生动态突变。
3.一种眼咽远端型肌病生物标记物,其特征在于,包括权利要求1-2任一项中所述的GIPC1基因。
4.一种检测眼咽远端型肌病生物标记物的引物,其特征在于,所述引物是基于权利要求1或2中所述的GIPC1基因设计的。
5.根据权利要求4所述的引物,其特征在于,包括定性检测引物,如下(a)或(b):
(a)引物GIPC1-F:如SEQ ID NO.1所示;引物GIPC1-R:如SEQ ID NO.2所示;引物GIPC1-linker-R:如SEQ ID NO.3所示;
(b)引物GIPC1-F、引物GIPC1-R和/或引物GIPC1-linker-R的核苷酸序列中经过取代、缺失或添加至少一个核苷酸;优选的,还包括定量检测引物,如下(c)或(d):
(c)引物GIPC1-AL-F:如SEQ ID NO.4所示;引物GIPC1-AL-R:如SEQ ID NO.5所示;
(d)引物GIPC1-AL-F和/或引物GIPC1-AL-R的核苷酸序列中经过取代、缺失或添加至少一个核苷酸。
6.一种检测眼咽远端型肌病生物标记物的试剂盒,其特征在于,包括权利要求4或5所述的引物。
7.一种检测眼咽远端型肌病生物标记物的方法,其特征在于,包括利用权利要求4或5所述的引物或权利要求6所述的试剂盒进行PCR扩增。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,还包括定性检测PCR反应体系和/或定量检测PCR反应体系;所述定性检测PCR反应体系和/或定量检测PCR反应体系中均含有PrimeSTAR GXL DNA聚合酶、1×PrimeSTAR GXL缓冲液、dATP、dTTP、dCTP、7-Deaza-dGTP、二甲基亚砜和/或甜菜碱;
优选的,定性检测PCR反应体系,总反应体积为20μl:含有0.25U Prime STAR GXL DNA聚合酶,1×PrimeSTAR GXL缓冲液,200μM的dATP,200μM的dTTP,200μM的dCTP,200μM的7-Deaza-dGTP,体积百分比5%二甲基亚砜,1M甜菜碱,0.3μM引物GIPC1-F,0.3μM引物GIPC1-linker-R,0.1μM引物GIPC1-R和100ng基因组DNA;
优选的,定量检测PCR反应体系,总反应体积为20μl:含有0.25U Prime STAR GXL DNA聚合酶,1×PrimeSTAR GXL缓冲液,200μM的dATP,200μM的dTTP,200μM的dCTP,200μM的7-Deaza-dGTP,体积百分比5%二甲基亚砜,1M甜菜碱,0.3μM引物GIPC1-AL-F,0.3μM引物GIPC1-AL-R,和100ng基因组DNA。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,还包括定性PCR反应条件和/或定量PCR反应条件;所述定性检测PCR反应条件和/或定量检测PCR反应条件均为:98℃下反应10分钟;然后进行9个循环:98℃反应30秒,66℃反应15秒,每个循环下降1℃,72℃下反应4分钟;接着是28个循环:98℃反应30秒,58℃反应15秒,72℃反应4分钟;最后延伸步骤72℃,10分钟。
10.权利要求4-5任一项所述的引物或权利要求6所述的试剂盒在制备诊断、检测或治疗眼咽远端型肌病的产品中的用途。
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