[发明专利]一种眼咽远端型肌病生物标记物和检测方法及其用途有效

专利信息
申请号: 202010339754.5 申请日: 2020-04-26
公开(公告)号: CN113549683B 公开(公告)日: 2023-10-24
发明(设计)人: 邓健文;于佳希;王朝霞;袁云 申请(专利权)人: 北京大学第一医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 代理人: 尹力
地址: 100034 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 远端 型肌病 生物 标记 检测 方法 及其 用途
【权利要求书】:

1.GIPC1基因在制备诊断、检测或治疗眼咽远端型肌病的产品中的用途。

2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于,GIPC1基因的5’UTR区域GGC或CGG序列发生动态突变。

3.一种眼咽远端型肌病生物标记物,其特征在于,包括权利要求1-2任一项中所述的GIPC1基因。

4.一种检测眼咽远端型肌病生物标记物的引物,其特征在于,所述引物是基于权利要求1或2中所述的GIPC1基因设计的。

5.根据权利要求4所述的引物,其特征在于,包括定性检测引物,如下(a)或(b):

(a)引物GIPC1-F:如SEQ ID NO.1所示;引物GIPC1-R:如SEQ ID NO.2所示;引物GIPC1-linker-R:如SEQ ID NO.3所示;

(b)引物GIPC1-F、引物GIPC1-R和/或引物GIPC1-linker-R的核苷酸序列中经过取代、缺失或添加至少一个核苷酸;优选的,还包括定量检测引物,如下(c)或(d):

(c)引物GIPC1-AL-F:如SEQ ID NO.4所示;引物GIPC1-AL-R:如SEQ ID NO.5所示;

(d)引物GIPC1-AL-F和/或引物GIPC1-AL-R的核苷酸序列中经过取代、缺失或添加至少一个核苷酸。

6.一种检测眼咽远端型肌病生物标记物的试剂盒,其特征在于,包括权利要求4或5所述的引物。

7.一种检测眼咽远端型肌病生物标记物的方法,其特征在于,包括利用权利要求4或5所述的引物或权利要求6所述的试剂盒进行PCR扩增。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,还包括定性检测PCR反应体系和/或定量检测PCR反应体系;所述定性检测PCR反应体系和/或定量检测PCR反应体系中均含有PrimeSTAR GXL DNA聚合酶、1×PrimeSTAR GXL缓冲液、dATP、dTTP、dCTP、7-Deaza-dGTP、二甲基亚砜和/或甜菜碱;

优选的,定性检测PCR反应体系,总反应体积为20μl:含有0.25U Prime STAR GXL DNA聚合酶,1×PrimeSTAR GXL缓冲液,200μM的dATP,200μM的dTTP,200μM的dCTP,200μM的7-Deaza-dGTP,体积百分比5%二甲基亚砜,1M甜菜碱,0.3μM引物GIPC1-F,0.3μM引物GIPC1-linker-R,0.1μM引物GIPC1-R和100ng基因组DNA;

优选的,定量检测PCR反应体系,总反应体积为20μl:含有0.25U Prime STAR GXL DNA聚合酶,1×PrimeSTAR GXL缓冲液,200μM的dATP,200μM的dTTP,200μM的dCTP,200μM的7-Deaza-dGTP,体积百分比5%二甲基亚砜,1M甜菜碱,0.3μM引物GIPC1-AL-F,0.3μM引物GIPC1-AL-R,和100ng基因组DNA。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,还包括定性PCR反应条件和/或定量PCR反应条件;所述定性检测PCR反应条件和/或定量检测PCR反应条件均为:98℃下反应10分钟;然后进行9个循环:98℃反应30秒,66℃反应15秒,每个循环下降1℃,72℃下反应4分钟;接着是28个循环:98℃反应30秒,58℃反应15秒,72℃反应4分钟;最后延伸步骤72℃,10分钟。

10.权利要求4-5任一项所述的引物或权利要求6所述的试剂盒在制备诊断、检测或治疗眼咽远端型肌病的产品中的用途。

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