[发明专利]整合脑神经元单细胞形态和单细胞转录组信息的方法

权利要求书

1.一种整合脑神经元单细胞形态和单细胞转录组信息的方法，其特征在于，该方法是先对新鲜大脑目标脑区的神经元进行单细胞转录组分析，确定代表这些神经元细胞类型的独有标签基因；然后，对同种属、同性别、且同年龄大脑内相同目标脑区的神经元进行荧光标记并断层成像，得到各个脑片，获取这些神经元的单细胞形态；最后，取含有这些神经元胞体的脑片，通过标签基因原位杂交的介导，实现这些神经元单细胞形态和单细胞转录组信息的间接整合；

其中，所述独有标签基因与所述神经元细胞类型一一对应，这些独有标签基因是通过单细胞转录组分析得到的；对于任意一个独有标签基因，该标签基因仅在一种神经元细胞类型中表达，在其他神经元细胞类型中并不表达；

所述标签基因原位杂交的介导，具体是以含有被标记神经元的成像过的脑片为样本，以独有标签基因为靶标，进行原位杂交并成像确定这些神经元标签基因的表达情况，通过这些脑片的先后两次成像获取冗余信息，以冗余信息为基础，实现神经元标签基因表达情况与神经元单细胞形态的配准，从而将标签基因以及标签基因所代表的该神经元细胞类型其他转录组信息，整合到神经元单细胞形态中；

所述冗余信息具体是指大脑被包埋后断层成像以及脑片原位杂交后成像，先后两次成像获取的同一神经元细胞或细胞结构的重复图像信息；这些重复信息包括荧光标记的神经元细胞形态信息、或细胞核分布密度、或细胞核形态大小信息。

2.如权利要求1所述方法，其特征在于，所述荧光标记包括嗜神经病毒介导荧光蛋白，或者其他方式介导荧光蛋白或荧光染料，标记活体大脑目标脑区的神经元。

3.如权利要求1所述方法，其特征在于，所述断层成像是通过机械切削被包埋的大脑实现的。

4.如权利要求1所述方法，其特征在于，所述脑为哺乳动物大脑。