[发明专利]一种高通量低成本的微量生物样品分子鉴定技术有效

专利信息
申请号: 202010347115.3 申请日: 2020-04-28
公开(公告)号: CN111440847B 公开(公告)日: 2023-06-16
发明(设计)人: 彭华正;金群英;朱汤军;叶华琳 申请(专利权)人: 浙江省林业科学研究院
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6869
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 310023 浙江省杭州市西湖*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 通量 低成本 微量 生物 样品 分子 鉴定 技术
【权利要求书】:

1.一种高通量低成本的微量生物样品分子鉴定技术,其特征在于该技术包括以下步骤:

(1)样品收集:在小型离心管中收集微量微生物样品,包含液体的样品通过短时间高速离心,去除液体部分;

(2)样品裂解:加入直径0.1mm-0.5mm玻璃珠至管总体积的1/8,加入1/8管总体积的1mg/ml浓度的proteinase K悬液,40-70℃保温5-30分钟后,立即1000rpm以上速度进行水平或垂直震荡;

(3)核酸收集:加入5-10%浓度的1/4管总体积的chelex液,80-95℃保温10-30min,短时间高速冷冻离心,取上清液冷冻保存;

(4)带标记引物的PCR扩增:

①根据待扩增基因序列的保守区设计通用的上下游引物;

②在上下游引物5’端至引物的中部区域之间引入1-2个错配碱基作为特异标记,上游引物设计24种错配组合,下游引物设计16种错配组合,这样就形成了384个不同的引物组合,可以对应384个不同PCR管位置;

③在引物的5’端加上30-35个碱基的接头,衔接后续高通量测序时的PCR扩增,同时进一步加强扩增稳定性;

④各个样品利用带有不同标记位点的引物分别进行扩增;

(5)PCR产物混合测序和位置还原:将各管PCR产物混合后进行高通量测序,通过各管引物标记组合的不同将各序列还原到各位置样品管中。

2.根据权利要求1所述的高通量低成本的微量生物样品分子鉴定技术,其特征在于:这里的微量生物样品泛指便于微量移液管操作的各种生物样品。

3.根据权利要求1所述的高通量低成本的微量生物样品分子鉴定技术,其特征在于:提取容器可以是在多个单管操作、12联管、96孔板或384孔板装置中同时操作,实现高通量低成本。

4.根据权利要求1所述的高通量低成本的微量生物样品分子鉴定技术,其特征在于步骤(5)的具体内容有:

①扩增后每管各取1-5μl产物进行混合,混合后作为一个样品进行高通量测序;

②测序得到的数十万条序列,利用计算机软件识别其标记位点,重新把序列分配到各样品管中。

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