[发明专利]一种提高多重PCR扩增文库质量的方法有效
申请号: | 202010358106.4 | 申请日: | 2020-04-29 |
公开(公告)号: | CN111518879B | 公开(公告)日: | 2021-02-12 |
发明(设计)人: | 黄文潘;浦浩;张亚楠 | 申请(专利权)人: | 上海茂槿生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C40B50/06 |
代理公司: | 深圳舍穆专利代理事务所(特殊普通合伙) 44398 | 代理人: | 黄贤炬 |
地址: | 201815 上海市嘉*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提高 多重 pcr 扩增 文库 质量 方法 | ||
1.一种提高多重PCR扩增文库质量的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)根据多重PCR中每个扩增子的扩增靶标序列,人工合成若干条差异靶标序列;
所述差异靶标序列的两端具有与所述扩增子的引物互补配对的片段;
2)所述差异靶标序列与所述扩增靶标序列的差异大小用编辑距离定义,编辑距离大于5的差异通过测序被区分;
所述编辑距离是指两段序列之间,由一段序列转成另一段所需要的最少编辑操作次数,所述编辑的形式包括插入、缺失和替换中一种或几种;
3)将步骤1)中若干条人工合成的差异靶标序列中,不少于扩增子总数量的10%进行混合,构建得到多重PCR人工合成带差异的序列集合;
4)以待测样本为反应模板,将所述多重PCR人工合成带差异的序列集合加入反应体系中进行多重PCR扩增反应,得到高质量的多重PCR扩增文库。
2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤1)中多重PCR中扩增子是候选检测生物分别经多重PCR引物扩增得到的扩增产物。
3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤1)中多重PCR中扩增子的数量根据候选检测生物的数量而决定。
4.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤1)中所述差异靶标序列中,以4种碱基数比例之和为100%计,4种碱基数量的比例均不大于70%。
5.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤2)中在多重PCR人工合成带差异的序列集合中,各带差异序列的靶标序列的拷贝数不大于108拷贝/mL。
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