[发明专利]一种基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒在审
申请号: | 202010359815.4 | 申请日: | 2020-04-30 |
公开(公告)号: | CN111500777A | 公开(公告)日: | 2020-08-07 |
发明(设计)人: | 金勇丰;张鹏;谢珍;邢宽;何志健 | 申请(专利权)人: | 嘉兴实践医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 314000 浙江省嘉兴市嘉善*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 荧光 rt pcr 方法 检测 新型 冠状病毒 核酸 试剂盒 | ||
1.一种基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,包括微载体、引物对和探针;所述微载体具有与冠状病毒一一对应的编码信息,所述的引物对包括上游引物和下游引物,所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,所述探针序列如SEQ ID NO:3所示。
2.根据权利要求1所述的基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,其中,所述探针的核酸在5’端连接有荧光报告基团,在核酸的3’端连接有荧光淬灭基团,且两个探针的荧光报告基团不同。
3.根据权利要求1所述的基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,其中,所述荧光报告基团选自FAM、VIC、ROX、CY3和CY5中的任一种。
4.根据权利要求1所述的基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,其中,所述荧光淬灭基团选自TAMRA、BHQ1、BHQ2和NFQ中的任一种。
5.根据权利要求1所述的基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,其中,所述试剂盒还包含PCR缓冲液以及Taq酶。
6.根据权利要求1所述的基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,其中,所述试剂盒还包括阳性对照和阴性对照。
7.根据权利要求6所述的基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,其中,所述阳性对照液为含有新型冠状病毒的扩增序列。
8.根据权利要求6所述的基于荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸的试剂盒,其中,所述阴性对照为RNase Free H2O。
9.一种新型冠状病毒的RT-PCR检测方法,该方法包括以下步骤:
一、RT-PCR引物和探针设计
根据已获得的新型冠状病毒外膜蛋白基因序列,使用软件Primer Premier 5设计2条用于建立检测方法的引物和1条探针,所述引物和探针序列如SEQ ID NO:1~3所示:
二、采集样品,将含有检测目的片段重组质粒的构建和作为阳性对照的小RNA片段的制备,在体外构建用于体外转录的重组质粒,然后体外转录获得小RNA片段;
三、引物的特异性实验和灵敏度检测实验
1)特异性检测
使用冠状病毒的RNA为模板进行RT-PCR实验;RT-PCR和PCR反应条件和程序如下:
混合均匀后42℃反应1h,70℃反应15min终止反应后迅速置于冰上,然后将获得的逆转录产物作为模板进行PCR扩增,反应体系和反应程序如下:
PCR程序为:60℃15min;95℃10s,92℃30s,60℃60s,45个循环;72℃5min;
2)灵敏度检测实验
检测该方法的敏感性,分别取不同浓度梯度的作为阳性对照的RNA 2μl为模板进行RT-PCR,逆转录和PCR条件和程序同特异性实验,然后使用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测结果。
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