[发明专利]用于检测KRAS基因和BRAF基因突变的引物组及其应用方法在审
申请号: | 202010367817.8 | 申请日: | 2020-04-30 |
公开(公告)号: | CN111500727A | 公开(公告)日: | 2020-08-07 |
发明(设计)人: | 赵方圆;佟洪梅;智慧芳;倪君君 | 申请(专利权)人: | 北京和合医学诊断技术股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 济南信达专利事务所有限公司 37100 | 代理人: | 程佩玉 |
地址: | 101111 北京市北京经济技术开发区经*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 kras 基因 braf 基因突变 引物 及其 应用 方法 | ||
1.用于检测KRAS基因和BRAF基因突变的引物组,其特征在于,包括下述至少一个用于检测KRAS基因的引物对和用于检测BRAF基因的引物对:
用于检测KRAS基因第2号外显子的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
用于检测KRAS基因第3号外显子的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
用于检测BRAF基因第15号外显子的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。
2.一种权利要求1所述的用于检测KRAS基因和BRAF基因突变的引物组的应用方法,其特征在于,包括:
设计权利要求1所述的引物组;
从待测样本中提取DNA作为扩增模板;
配制包含所述引物组和所述扩增模板的多重聚合酶链式反应PCR反应体系;
对所述多重PCR反应体系进行多重PCR扩增反应,得到PCR产物;
根据所述PCR产物,确定所述待测样本的KRAS基因的第2、3号外显子和BRAF基因的第15号外显子的基因突变情况。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,
所述根据所述PCR产物,确定所述待测样本的KRAS基因的第2、3号外显子和BRAF基因的第15号外显子的基因突变情况,包括:
电泳检测所述PCR产物,获得所述PCR产物的扩增片段大小;
当所述PCR产物的扩增片段大小正确时,对所述PCR产物进行序列测定,获得所述待测样本的KRAS基因的第2、3号外显子和BRAF基因的第15号外显子的基因突变情况。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,
所述多重PCR反应体系还包括:DNA聚合酶、所述DNA聚合酶对应的PCR缓冲液、4种脱氧核糖核苷三磷酸dNTP的混合物和超纯水;
其中,DNA聚合酶的用量为0.5-5U,每种dNTP的终浓度为50-500μM,所述引物组中每条引物的终浓度为20-300nM。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,
所述DNA聚合酶,包括:Taq聚合酶、KOD FX、Phusion或Platinum聚合酶。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,
所述PCR反应体系的反应条件包括:92-95℃,预变性1~8min;92-98℃,变性5~20s;52~68℃,退火10~60s;68~72℃,延伸0.2~5min将变性、退火、延伸循环25~40次,65~74℃,终延伸0~30min。
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