[发明专利]禾谷镰刀菌的RT-QPCR检测的引物、探针、试剂盒及方法在审
申请号: | 202010370372.9 | 申请日: | 2020-05-06 |
公开(公告)号: | CN111471794A | 公开(公告)日: | 2020-07-31 |
发明(设计)人: | 车团结;张镭;沈颂东;朱建宁;孙宗科;石勇;高恺;李潇玲;郑晓玲 | 申请(专利权)人: | 兰州百源基因技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12Q1/06;C12N15/11;C12R1/77 |
代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 刘小彬 |
地址: | 730030 甘肃省兰州*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 禾谷 镰刀 rt qpcr 检测 引物 探针 试剂盒 方法 | ||
1.禾谷镰刀菌的RT-QPCR检测的引物,其特征在于,所述引物包括上游引物和下游引物,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示,
上游引物:5'-TCGAGCTTCCATAGCGTAG-3';
下游引物:5'-GATCCGAGGTCAACATTCAGA-3'。
2.禾谷镰刀菌的RT-QPCR检测的探针,其特征在于,所述探针的核苷酸序列如SEQ IDNO:3所示:5'-TAATCGTCGCGGCCACTCC-3';优选地,所述探针5’端标记的荧光报告基团为FAM,3’端标记的荧光淬灭基团为TAMAR。
3.植物植物禾谷镰刀菌的RT-QPCR检测的引物及探针组合,其特征在于,包括:
上游引物:5'-TCGAGCTTCCATAGCGTAG-3';
下游引物:5'-GATCCGAGGTCAACATTCAGA-3';
探针:5'-TAATCGTCGCGGCCACTCC-3'。
4.一种禾谷镰刀菌的RT-QPCR检测的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1所述的引物、及权利要求2所述的探针。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,还包括QPCR模板,所述QPCR模板如SEQID NO:4所示;优选地,所述模板是以质粒的形式存在。
6.根据权利要求4或5所述的试剂盒,其特征在于,还包括阴性样品;优选地,所述阴性对照样品为ddH2O。
7.根据权利要求4或5所述的试剂盒,其特征在于,还包括预混液;优选地,所述预混液为2×Probe Mix。
8.一种禾谷镰刀菌的RT-QPCR检测的反应体系,其特征在于,所述反应体系包括:
上游引物:5'-TCGAGCTTCCATAGCGTAG-3';
下游引物:5'-GATCCGAGGTCAACATTCAGA-3';
探针:5'-TAATCGTCGCGGCCACTCC-3';
模板:如SEQ ID NO:4所示;
优选地,还包括阴性对照样品,进一步优选地,所述阴性对照样品为ddH2O。
9.一种检测植物禾谷镰刀菌的RT-QPCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1.提取待测样品总DNA;
步骤2.制备反应体系,所述反应体系如权利要求8所述;
步骤3.将模板梯度稀释制成标准曲线样品及阳性对照样品;
步骤4.将待测样品、标准曲线样品、阳性对照样品、阴性对照样品使用所述引物和探针,进行荧光定量PCR扩增;
步骤5.绘制标准曲线,通过标准曲线和待测样品的Ct值计算结果;
优选地,所述步骤3中,梯度稀释制得的标准曲线样品的浓度分别为3.17×109copies/μL、3.17×108copies/μL、3.17×107copies/μL、3.17×106copies/μL、3.17×105copies/μL、3.17×104copies/μL、3.17×103copies/μL、3.17×102copies/μL、3.17×101copies/μL;
优选地,所述阳性对照样品的浓度为3.17×1010copies/μL。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,PCR的反应条件为:37℃污染消化2min,95℃预变性10min,1个循环;95℃15s、60℃20s、72℃40s并收集荧光信号,40个循环。
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