[发明专利]一种基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒及方法在审
申请号: | 202010376847.5 | 申请日: | 2020-05-07 |
公开(公告)号: | CN111471770A | 公开(公告)日: | 2020-07-31 |
发明(设计)人: | 唐春花;张鹏;邢宽;何志健;谢珍;夏统前;袁鸣;何贵伦;安雪茹;李平 | 申请(专利权)人: | 南京实践医学检验有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686 |
代理公司: | 南京瑞华腾知识产权代理事务所(普通合伙) 32368 | 代理人: | 梁金娟 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 多重 荧光 rt pcr 检测 白血病 融合 基因 试剂盒 方法 | ||
1.一种基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,包括分开设置的第1-9号试剂包,所述1-9号试剂包的每一个包含引物对和探针,所述引物对包括上游引物和下游引物,所述引物对和探针至少包含以下各个融合基团对应的序列:
2.根据权利要求1所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述探针为Taqman探针,在其核酸的5’端连接有荧光报告基团,在其核酸的3’端连接有荧光淬灭基团,且三个探针的荧光报告基团不同。
3.根据权利要求2所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述荧光报告基团选自FAM、VIC、ROX中的任一种。
4.根据权利要求2所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述荧光淬灭基团为BHQ1。
5.根据权利要求1所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述试剂盒的第7号试剂包还包含内标系统,所示内标系统是根据内参基因GAPDH序列设计的内标引物和内标探针,所述内标引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物的核酸序列如SEQ ID NO.133所示,所述下游引物的核酸序列如SEQ ID NO.134所示,所述内标探针的核酸序列如SEQ ID NO.135所示。
6.根据权利要求5所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述内标探针为Taqman探针,在其核酸的5’端连接有荧光报告基团ROX,在其核酸的3’端连接有BHQ1荧光淬灭基团。
7.根据权利要求1所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述试剂盒还包含荧光PCR反应液,所述荧光PCR反应液包含PCR缓冲液、dNTP、Hot Start TaqDNA聚合酶、UNG酶以及MgCl2。
8.根据权利要求1所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述试剂盒还包括第10号试剂包,所述第10号试剂包是阴性对照,所述阴性对照是体积为5ul的RNase Free H2O。
9.根据权利要求1所述的基于多重荧光RT-PCR检测白血病融合基因的试剂盒,其中,所述试剂盒还包括第11号试剂包,所述第11号试剂包是阳性对照,所述阳性对照为含有常见融合基因类型的cDNA混合液。
10.一种白血病融合基因的检测方法,该方法包括以下步骤:
S1、细胞培养:按照细胞培养的标准操作在细胞间培养K562细胞系、Kasumi细胞系、NB4细胞系、THP-1细胞系以及HL60细胞系,培养条件为37℃、5%CO2;
S2、RNA的提取:获取待测样品的核酸,核酸的提取采用Trans RNA Pure Blood Kit试剂盒获得细胞系中的RNA;
S3、RNA的逆转录:使用Promega GoScriptTMReverse Transcriptase试剂盒获得cDNA;
S4、荧光PCR扩增:采用本发明所述的试剂盒,以步骤S3中获取的cDNA为模板,进行PCR扩增,并收集荧光信号;
荧光PCR扩增的体系组成及含量为:
荧光PCR的反应条件为:先经过50℃2min的UNG反应,然后95℃10min;再然后经过95℃15s,60℃30s,共45个循环,扩增过程中仪器自动收集荧光信号;
S5、数据收集处理和分析:首先分析第7号试剂包内内参基因GAPDH的扩增信号,如果其CT值小于30,表明整个检测过程有效;如果其CT值大于30,则需要重新验证检测。
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