[发明专利]一种基于病原菌线粒体基因组序列检测西瓜枯萎病、番茄枯萎病和莲藕腐败病病原的方法

权利要求书

1.一种用于鉴定Fusarium commune和Fusarium oxysporum菌株的标志物，其特征在于，所述标志物选自F.commune特异序列1#、F.commune特异序列2#和F.oxysporum特异序列3#；

所述F.commune特异序列1#的序列如SEQ ID No. 1所示，具体为：

GAGTACACTTTGTTAGAGGACGAGTAAAAAAAAATACATTTTTTTACCCGTCCCCGCAAGCTAAGCTCTAGCTAATTATTTAAATATATCTAAAGTAACTGTAGGTAAGTATTTAAATAATGAACTAATCTATAAAAACGAGCTTTAGCACATTTTTCTAGGAAGGCGTAAGCTCTAGCGCAGCCTACATATTTAAACCTATAAATTAATAATTTTGAGTATAAG；

所述F.commune特异序列2#的序列如SEQ ID No. 2所示，具体为：

TATCTCGTCCTCCCTACTACACGATTTTATGTCTATATGAAGGCGCAAGCTCGTAGATATACCCGTCCTTTACCTGATTTAGTAATGCTACGTCTTGCT；

所述F.oxysporum特异序列3#的序列如SEQ ID No. 3所示，具体为：

CAGTAGCATATTATCTGTGCTGTTTTTGGCTAAATCTAGTCACCAGCTACCGCTATTACAGAAATTACTGGTATTAGCTAACTATAAGCTAAGCTTCGGTTAGCCTA。

2.一种寡核苷酸引物，其特征在于，所述寡核苷酸引物根据权利要求1所述的F.commune特异序列1#、F.commune特异序列2#和F.oxysporum特异序列3#设计，所述寡核苷酸引物为普通PCR引物、荧光定量PCR引物或LAMP引物；所述寡核苷酸引物用于检测引起西瓜枯萎病、番茄枯萎病以及莲藕腐败病的病原菌，所述病原菌为Fusarium commune和Fusarium oxysporum菌株；

其中，所述普通PCR引物包括：

所述荧光定量PCR引物包括：

所述LAMP引物包括：

。

3.一种如权利要求1所述的标志物、或由权利要求2所述的寡核苷酸引物在检测引起西瓜枯萎病、番茄枯萎病和莲藕腐败病的病原菌中的应用。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述应用为用于鉴定Fusarium commune和Fusarium oxysporum菌株，所述鉴定包括步骤：根据权利要求2所述的寡核苷酸引物，利用聚合酶链式反应、环介导等温扩增或荧光定量PCR扩增如权利要求1所述的的F.commune特异序列1#、F.commune特异序列2#和F.oxysporum特异序列3#。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，采用聚合酶链式反应时，在无需任何核酸提取步骤的前提下，直接扩增靶标菌培养物上清液，进而对靶标病原菌进行检测；或者，采用环介导等温扩增时，在无需任何核酸提取步骤的前提下，直接扩增靶标菌培养物上清液或发病植株茎秆的渗出液，进而对靶标病原菌进行检测。