[发明专利]一种鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.一种鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为SEQID NO.1所示的核苷酸序列，所述SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列第101位碱基处存在T/G碱基突变，该突变位点碱基为GG的甜瓜高抗白粉病；该突变位点碱基为TT的甜瓜高感白粉病；所述甜瓜品种为以wm-6为母本，以12D-1为父本进行杂交和自交的F2代。

2.用于检测甜瓜抗白粉病形状的SNP分子标记的特异性引物组合，其特征在于，包括：

(1)两条特异性引物：

Primer X：

5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAAGCTAAGGACTTATGGTTGATCT-3’；

Primer Y：

5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAAGCTAAGGACTTATGGTTGATCG-3’；

和(2)一条通用引物

Primer C：

5’-TCGTGTATCTCGATTGCTCATGAT-3’；所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列第101位碱基处存在T/G碱基突变，该突变位点碱基为GG的甜瓜高抗白粉病；该突变位点碱基为TT的甜瓜高感白粉病；所述甜瓜品种为以wm-6为母本，以12D-1为父本进行杂交和自交的F2代。

3.一种鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记的试剂或试剂盒，其特征在于，含有权利要求2所述的特异性引物组合，所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列第101位碱基处存在T/G碱基突变，该突变位点碱基为GG的甜瓜高抗白粉病；该突变位点碱基为TT的甜瓜高感白粉病；所述甜瓜品种为以wm-6为母本，以12D-1为父本进行杂交和自交的F2代。

4.权利要求2所述的SNP分子标记的特异性引物组合在检测甜瓜品种抗白粉病性状中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述SEQ IDNO.1所示的核苷酸序列第101位碱基处存在T/G碱基突变，该突变位点碱基为GG的甜瓜高抗白粉病；该突变位点碱基为TT的甜瓜高感白粉病；所述甜瓜品种为以wm-6为母本，以12D-1为父本进行杂交和自交的F2代。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，包括如下步骤：

(1)提取待测甜瓜基因组DNA；

(2)以甜瓜基因组DNA为模板，利用权利要求2所述的SNP分子标记的特异性引物组合进行KASP反应检测；

两条特异性引物的5’-端分别连接FAM-tail：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’和VIC-tail：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’通用荧光标签序列；

(3)若只检测到引物Primer Y所连荧光序列对应的荧光信号，则表明待测甜瓜抗白粉病，若只检测到引物Primer X所连荧光序列对应的荧光信号，则判定待测甜瓜不抗白粉病，若同时检测到两种荧光信号则判断待测甜瓜为携带抗白粉病性状的杂合型；选择检测到引物Primer Y所连荧光序列对应的荧光信号的甜瓜样本进行育种。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，步骤(2)中KASP检测中的PCR条件为：94℃15min；95℃ 20sec，65-56℃ 60sec，每个循环退火延伸温度降低0.8℃，共10个循环；94℃20sec，57℃ 60sec，共26个循环。

7.权利要求3所述的鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记的试剂盒在培育抗白粉病甜瓜中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述SEQID NO.1所示的核苷酸序列第101位碱基处存在T/G碱基突变，该突变位点碱基为GG的甜瓜高抗白粉病；该突变位点碱基为TT的甜瓜高感白粉病；所述甜瓜品种为以wm-6为母本，以12D-1为父本进行杂交和自交的F2代。