[发明专利]一种鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记及其应用

说明书

本本发明公开了一种用于鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记及其应用。本发明提供了一个与甜瓜抗白粉病QTL紧密连锁的SNP标记，该标记位于甜瓜第12号染色体第23930811碱基处。本发明利用获得的分子标记及其特异性引物，可用于甜瓜抗白粉病品种或品系的选育，从而减少工作量，降低育种成本，加快育种进程，具有很高的实际应用价值。

技术领域

本发明属于基因工程及分子生物学领域，具体涉及一种鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记及其应用。

背景技术

甜瓜(Cucumis Melo L.)为葫芦科甜瓜属一年生蔓性草本植物，是世界范围内种植最广的经济作物之一。白粉病(powdery mildew,PM)作为甜瓜等葫芦科作物上广泛发生的一种世界性真菌病害，在露地栽培和保护地栽培中广泛发生。甜瓜感染白粉病菌后不仅导致其产量下降，同时还影响果实的成熟度和含糖量，从而降低甜瓜的品质和商品性，进而造成巨大的经济损失。

目前白粉病的防治方法主要是化学防治，既费时又费力，而且也不能完全抑制白粉病的发生，另外药剂施用过多不仅使白粉病菌产生抗药性，还会导致农药残留，对生态环境以及食品安全造成严重危害，威胁人类健康。

培育白粉病抗性新品种，是防治甜瓜白粉病最经济、最环保和最有效的措施。传统的抗病育种工作中，每一代都需要采用田间接种病原菌进行性状鉴定的方法，存在表型把控不准、遗传群体需求量大、费时费力、育种周期长、易受环境因素影响等缺陷，因此很难实现材料的遗传改良或是大规模商业化集成育种。随着分子生物学和生物信息学的发展，分子标记辅助选择(Marker-assisted selection,MAS)技术为育种工作提供了有利工具。该技术是利用与目标基因连锁的分子标记，通过DNA水平的检测即可完成对目标性状的选择，能够提高选择效率，减少工作量，从而加快育种进程。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，可由单个碱基的转换或颠换引起，也可由碱基(片段)的插入或缺失所致。针对这些多态性位点逐步兴起了新一代的SNP分子标记技术。该技术针对控制目标性状的基因开发功能SNP标记，将性状与基因型相关联，进而实现高效、精准育种。现阶段，适用于SNP标记的检测手段主要包括凝胶电泳、荧光定量PCR和竞争性等位基因PCR(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)。本发明所开发的标记适用于KASP方法检测SNP位点。该方法已陆续应用于分子辅助育种、目标性状基因定位、种子纯度及真实性鉴定等研究领域，具有成本低、通量高、实验操作简单和安全等优势。

本发明所开发的分子标记可快速、准确地对甜瓜抗白粉病的品种或品系进行选育，从而有效减少工作量，提高工作效率，降低育种成本，加快育种进程，具有很高的实际应用价值。

发明内容

本发明提供了一种鉴定甜瓜抗白粉病性状的SNP分子标记及其应用。利用该分子标记可以在甜瓜苗期进行DNA水平上的鉴定，从而克服甜瓜传统育种中需要接种病原菌鉴定抗病性的缺点，大大简化甜瓜抗白粉病品种或品系的培育过程。

本发明所采用的技术方案如下：

本发明提供了一种与甜瓜抗白粉病性状相关的SNP分子标记CM_KA002188，其序列为：