[发明专利]一种小麦粒长相关SNP标记及其应用有效
申请号: | 202010428817.4 | 申请日: | 2020-05-18 |
公开(公告)号: | CN111518933B | 公开(公告)日: | 2022-03-11 |
发明(设计)人: | 曹佳佳;张海萍;徐康乐;常成;卢杰;马传喜 | 申请(专利权)人: | 安徽农业大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12N15/11 |
代理公司: | 安徽汇朴律师事务所 34116 | 代理人: | 刘海涵 |
地址: | 230036 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 麦粒 相关 snp 标记 及其 应用 | ||
1.一种与小麦粒长相关的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记位于参考基因组IWGSCRefSeq v2.0版本的小麦7A染色体450729566bp处,且这一SNP标记的核苷酸为G/C。
2.一种鉴定小麦粒长的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
步骤1、提取待测小麦基因组DNA
步骤2、设计跨权利要求1所述SNP标记的PCR引物对SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3,利用SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所述的序列对步骤1获得的小麦基因组DNA进行PCR扩增,获得扩增产物;
步骤3、利用限制性内切酶RsaI对所述扩增产物进行酶切,获得酶切产物;
步骤4、当步骤2获得的扩增产物可被酶切时,其对应的小麦为长粒小麦,若步骤2获得的扩增产物不可被酶切时,其对应的小麦为短粒小麦。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤2的PCR扩增体系配置:1μL 2.5mMdNTP,0.25μL 10μM引物,1μL 10×EasyTaq Buffer,0.5U EasyTaq,100ng DNA模板,用双蒸馏水补齐到10μL;
PCR扩增程序:94℃预变性5min;94℃变性30s;62℃开始每循环降落0.3℃退火30;72℃延伸30s,40个循环;72℃延伸8min。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤3中酶切体系为:5μL PCR产物,1μL10×CutSmart Buffer,0.5U RsaI,用双蒸馏水补齐到10μL。
5.根据权利要求2-4任一所述的方法,其特征在于,所述小麦品种具体为京411或红芒春21。
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