[发明专利]一种RT-LAMP法检测口蹄疫病毒的引物组和试剂盒及其应用有效
申请号: | 202010435997.9 | 申请日: | 2020-05-21 |
公开(公告)号: | CN111455113B | 公开(公告)日: | 2021-04-02 |
发明(设计)人: | 苗海生;谢佳芮;寇美玲;李乐;廖德芳;李华春 | 申请(专利权)人: | 云南省畜牧兽医科学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京艾皮专利代理有限公司 11777 | 代理人: | 李德胜 |
地址: | 650224*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rt lamp 检测 口蹄疫病毒 引物 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种RT-LAMP法检测口蹄疫病毒的引物组,所述引物组包括6条引物,分别为:两条外引物:正向外引物F3、反向外引物B3;两条内引物:正向内引物FIP、反向内引物BIP;两条环引物:上游环引物LF、下游环引物LB,其特征在于,所述6条引物具体序列如下:
正向外引物F3:5'-GACAAAAGYGACAAAGGTT-3';
反向外引物B3:5'-TAAAGTGATCTGTAGCTTGG-3';
正向内引物FIP:5'-CGTGCAAAGGAGAGGATAGCCTC-CYGATGTCACTTTCCTCAAAAG-3';
反向内引物BIP:5'-GACCATACAGGAGAAGTTGA-AAGAGRCCCTGGAAGGGCTCRAA-3';
上游环引物LF:5'-TAAAACCCAGTTCCATA-3';
下游环引物LB:5'-CTCGCCGTCCACTCTGG-3';
所述6条引物位于口蹄疫病毒高度保守的3D蛋白基因内,全基因组的7776-8050 bp处,所述序列如SEQ ID NO:1所示,其中所述反向外引物B3、反向内引物BIP和下游环引物LB为该基因片段的互补基因序列;
所述6条引物在所述全基因组的7776-8050 bp处的具体位置为:
正向外引物F3:7776bp~7794 bp;
反向外引物B3:8031bp~8050 bp;
正向内引物FIP:7899 bp~7921 bp 、7816 bp~7837 bp;
反向内引物BIP:7928 bp~7947 bp 、8001 bp~8023 bp;
上游环引物LF:7854 bp~7870 bp;
下游环引物LB:7962 bp~7978 bp。
2. 一种RT-LAMP法检测口蹄疫病毒的试剂盒,该试剂盒内包含RT-LAMP反应管、阳性对照样品、阴性对照样品、比色卡,其特征在于:所述RT-LAMP反应管内包括扩增反应体系和显色体系,扩增反应体系位于RT-LAMP反应管底部,显色体系位于RT-LAMP反应管管盖处;所述扩增反应体系中引物组为权利要求1所述的引物组;所述显色体系是用石蜡油封闭的荧光染料,所述荧光染料为PicoGreen;密封荧光染料的方式为:制备成品试剂盒时在RT-LAMP反应管管盖中滴加4μL PicoGreen,随后滴加15 μL石蜡油,把PicoGreen封闭于反应管管盖处。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,该试剂盒中引物组的正向外引物F3和反向外引物B3为外引物、正向内引物FIP和反向内引物BIP为内引物、上游环引物LF和下游环引物LB为环引物,其特征在于:所述外引物:内引物:环引物的摩尔含量比为1:8:2。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述扩增反应体系共23μL,具体包括:
10×等温扩增RT-LAMP反应液 2.5 μL,
8U/μL 的Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶 1.0μL,
10 mmol的dNTP 混合液 3.5μL,
100 mmol的硫酸镁 1.0 μL,
5U的AMV 反转录酶 1.0 μL,
ddH2O 3.0μL,
10μmol的正向外引物F3 0.5 μL,
10μmol的反向外引物B3 0.5 μL,
10μmol的正向内引物FIP 4.0 μL,
10μmol的反向内引物BIP 4.0 μL,
10μmol的上游环引物LF 1.0μL,
10μmol的下游环引物LB 1.0μL。
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