[发明专利]利用提升列表操作质谱仪

权利要求书

1.一种操作质谱仪以分析生物样品的方法，其包含：

在引入期期间将由所述生物样品生成的肽离子引入到所述质谱仪中；

使所述肽离子片段化以形成产物离子；

对所述产物离子进行质量分析以获取产物离子谱；以及

在所述引入期期间，使用编程控制器来执行：

执行质谱数据库的搜索，以鉴别所述质谱数据库中与所述产物离子谱匹配的候选肽，并且所述质谱数据库的所述搜索包括生成指示所述候选肽的匹配的置信度的候选肽得分，

判定所述候选肽得分在代表所述产物离子谱的可信匹配的阈值得分范围之外，

判定所述候选肽包括代表所述生物样品的所述分析所关注的肽的属性的提升列表中指定的属性，以及

在判定所述候选肽包括所述属性后，基于所述候选肽包括所述提升列表中指定的属性的判定，使所述质谱仪执行动作。

2.根据权利要求1所述的方法，其中引入肽离子包括电离所述生物样品的色谱分离组分，所述引入期由所述色谱分离组分的色谱洗脱峰宽限定。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述提升列表中指定的所述属性由用户定义。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中所述编程控制器将进一步执行：

判定所述候选肽不包括代表所述生物样品的所述分析所不关注的肽的属性的拒绝列表中指定的属性，并且其中使所述质谱仪执行所述动作也是基于所述候选肽不包括所述拒绝列表中指定的属性的判定。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述编程控制器将进一步执行：

基于所述候选肽包括所述提升列表中指定的属性的判定或所述候选肽不包括所述拒绝列表中指定的属性的判定，修改所述提升列表或所述拒绝列表。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述提升列表中指定的肽的所述属性包括所述候选肽所源自的蛋白质。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法，其中所述提升列表中指定的肽的所述属性包括与所述候选肽或所述候选肽所源自的蛋白质相关的生物体的生物系统。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中待执行的所述动作包括对所述产物离子中的一种或多种执行额外阶段的MSn分析。

9.一种用于分析生物样品的设备，其包含：

分离装置，其被配置成将所述生物样品按时序分离成组分；

电离源，其被配置成接收所述生物样品的组分并且在引入期期间由所述组分生成肽离子；

片段化装置，其被配置成使所述肽离子片段化以形成产物离子；

质量分析器，其被配置成分析所述产物离子以产生产物离子谱；以及

控制器，其被编程有用于以下的指令：

执行质谱数据库的搜索，以鉴别所述质谱数据库中与所述产物离子谱匹配的候选肽，并且所述质谱数据库的所述搜索包括生成指示所述候选肽的匹配的置信度的候选肽得分，

判定所述候选肽得分在代表所述产物离子谱的可信匹配的阈值得分范围之外，

判定所述候选肽包括代表所述生物样品的分析所关注的肽的属性的提升列表中指定的属性，以及

在判定所述候选肽包括所述属性后，基于所述候选肽包括所述提升列表中指定的属性的判定，使所述质谱仪执行动作。

10.根据权利要求9所述的设备，其中引入肽离子包括电离所述生物样品的色谱分离组分，所述引入期由所述色谱分离组分的色谱洗脱峰宽限定。

11.根据权利要求9或10所述的设备，其中所述提升列表中指定的所述属性由用户定义。