[发明专利]特异性检测TWI型传染性支气管炎病毒的反转录-实时荧光定量PCR试剂盒及其应用在审
申请号: | 202010474807.4 | 申请日: | 2020-05-29 |
公开(公告)号: | CN111534642A | 公开(公告)日: | 2020-08-14 |
发明(设计)人: | 张小荣;廖凯;吴艳涛;郭梦娇;陈淑琴;张成成;鄢坤;楚电峰;范根成;杜元钊 | 申请(专利权)人: | 扬州大学;青岛易邦生物工程有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 卢亚丽 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异性 检测 twi 传染性 支气管炎 病毒 转录 实时 荧光 定量 pcr 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种特异性检测TW I型IBV的RT-qPCR引物和探针,其特征在于,选自下述两套检测引物和探针之一,其中第一套检测引物和探针包括:上游引物TW I/F1序列为5’-AGAGATGTTGGRGAAGTCACTGTT-3’(SEQ ID NO.8),下游引物TW I/R1序列为5’-CTCTGGTAGTAGTAAACGTACGTATCATTATC-3’(SEQ ID NO.9),探针TW I/Probe1序列为5’-CACTATCTAGTGCTACTTTGTAT-3’(SEQ ID NO.10),所述荧光探针5’和3’端分别标记6-FAM基团和MGB基团;
第二套检测引物和探针包括:上游引物TW I/F2序列为5’-CGCTTATGCAGTAGTAAATGTTTCTTCAC-3’(SEQ ID NO.11),下游引物TW I/R2序列为5’-CCACCGCATACCTTGACCTACA-3’(SEQ ID NO.12),探针TW I/Probe2序列为5’-CATTAACAACTGTATCACCACT-3’(SEQ ID NO.13),所述荧光探针5’和3’端分别标记6-FAM基团和MGB基团。
2.一种特异性检测TW I型IBV的RT-qPCR试剂盒,其特征在于,试剂盒中含有权利要求1所述第一套检测引物和探针或/和第二套检测引物和探针。
3.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,还包含阳性标准品,所述的阳性标准品是含有TW I型IBV S1基因片段的质粒,所述的质粒是用引物TWI-S1F和TWI-S1R引物对从TW I型IBV毒株CK/CH/AH/2011/3基因组cDNA扩增出的包含完整S1基因的DNA片段连接到pEasyT3载体上得到的,所述引物TWI-S1F序列为5’-CTGCACGCAAATTATATATTTTGG-3’(SEQ IDNO.14),所述引物TWI-S1R序列为5’-GTATGTACTCATCTGTAACAGT-3’(SEQ ID NO.15),扩增目的片段大小为2kb。
4.如权利要求2或3所述试剂盒的使用方法,其特征在于,按照以下步骤进行:
(1)提取病毒样本的总RNA;
(2)反转录为cDNA;
(3)标准曲线建立将阳性标准品质粒从109拷贝/μl到101拷贝/μl系列稀释作为模板,以权利要求1中所述的引物和探针进行实时荧光定量PCR扩增,用于建立标准曲线;
(4)以步骤(2)反转录的cDNA为模板,以权利要求1中所述的引物和探针进行荧光定量PCR扩增;
(5)PCR反应过程中自动检测、采集荧光信号,根据标准曲线对待检样本中的病毒含量进行定量。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,荧光定量PCR的反应体系为20μl,20μl体系里含有10μl、2×qPCR Probe Master Mix、0.4μl上游引物、0.4μl下游引物、0.2μl探针、2μl模板cDNA和7μl无菌水。
6.如权利要求4所述的方法,其特征在于,荧光定量PCR的反应条件为:95℃5min;95℃10s、60℃30s,40个循环。
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