[发明专利]与油茶种仁含油率相关的3个SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记选自PB.103793.1-1118、PB.103793.1-1172和PB.103793.1-1175中的任一个；

其中，SNP分子标记PB.103793.1-1118如SEQ ID NO.3所示，其中第1118位的多态性为A/G；SNP分子标记PB.103793.1-1172如SEQ ID NO.3所示，其中第1172位的多态性为G/A；SNP分子标记PB.103793.1-1175如SEQ ID NO.3所示，其中第1175位的多态性为A/C。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记PB.103793.1-1118中，具有所述多态性的位点的基因型为A/A，对应于高含油率；基因型为A/G，对应于候选高含油率；基因型为G/G，对应于低含油率；

所述SNP分子标记PB.103793.1-1172中，具有所述多态性的位点的基因型为G/G，对应于高含油率；基因型为A/G，对应于候选高含油率；基因型为A/A，对应于低含油率；

所述SNP分子标记PB.103793.1-1175中，具有所述多态性的位点的基因型为A/A，对应于为高含油率；基因型为A/C，对应于候选高含油率，基因型为C/C，对应于低含油率。

3.与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记组合，其特征在于，所述SNP分子标记组合选自PB.103793.1-1118、PB.103793.1-1172和PB.103793.1-1175中的至少两个；

其中，SNP分子标记PB.103793.1-1118、PB.103793.1-1172和PB.103793.1-1175同权利要求1或2中所述。

4.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的引物。

5.根据权利要求4所述的引物，其特征在于，包括如SEQ ID NO.1-2所示的引物。

6.含有权利要求4或5所述的引物的试剂或试剂盒。

7.权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合或权利要求4或5所述的引物或权利要求6所述的试剂或试剂盒的以下任一应用：

（1）在鉴定油茶种仁含油率表型中的应用；

（2）在油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用，所述油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种的性状为油茶种仁含油率；

（3）在油茶种仁含油率的早期预测中的应用；

（4）在筛选高含油率油茶中的应用。

8.鉴定油茶种仁含油率表型的方法，其特征在于，包括：

（1）提取待鉴定油茶的总RNA，反转录合成cDNA；

（2）以cDNA为模板，利用权利要求4或5所述的引物进行PCR扩增；

（3）分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的基因型，根据所述基因型判断待鉴定油茶的种仁含油率表型。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤（2）中，所述PCR扩增的反应程序为：94~95℃，3~5min；94~95℃，15~30s，65~69℃，40~60s，38~45个循环；67~70℃，3~6min。

10.根据权利要求8或9所述的方法，其特征在于，步骤（3）中所述判断待鉴定油茶的种仁含油率表型的方法为：

若SNP分子标记PB.103793.1-1118具有所述多态性的位点的基因型为A/A，则待鉴定油茶为高含油率；若基因型为A/G，则待鉴定油茶为候选高含油率；若基因型为G/G，则待鉴定油茶为低含油率；和/或，

若SNP分子标记PB.103793.1-1172具有所述多态性的位点的基因型为G/G，则待鉴定油茶为高含油率；若基因型为A/G，则待鉴定油茶为候选高含油率；若基因型为A/A，则待鉴定油茶为低含油率；和/或，

若SNP分子标记PB.103793.1-1175具有所述多态性的位点的基因型为A/A，则待鉴定油茶为高含油率；若基因型为A/C，则待鉴定油茶为候选高含油率，若基因型为C/C，则待鉴定油茶为低含油率。