[发明专利]与油茶种仁含油率相关的3个SNP分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与油茶种仁含油率相关的3个SNP分子标记及其应用。本发明提供了3个与油茶种仁含油率高度关联的SNP分子标记PB.103793.1‑1118、PB.103793.1‑1172和PB.103793.1‑1175，可以分别解释29.07％、29.00％和28.75％的含油率表型方差。通过检测所述的SNP分子标记，可在苗期进行鉴定和辅助筛选，大大节约生产成本和提高选择效率。

技术领域

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与油茶种仁含油率相关的3个SNP分子标记及其应用。

背景技术

油茶(Camellia oleifera Abel.)隶属山茶科(Theaceae)山茶属(Camellia L.)，是木本油料树种。油茶籽油含有丰富的营养物质，是一种优质的食用油，其不饱和脂肪酸含量达90％以上，以油酸和亚油酸为主。油茶籽油具有抗氧化、抗肿瘤、降血脂等功效，具有较高的营养保健价值。目前，以选择和杂交育种为主要手段、以产果量为主要育种目的的油茶育种已取得了重要进展，但以提高种仁含油率、改良油脂品质为目的的育种研究仍较少。油茶的常规育种周期长，新品种选育缓慢，良种选育速度还不能满足产业发展的需求，这已成为限制油茶产业发展的重要因素之一。

相比于传统育种技术，分子标记辅助育种可从苗期开始选择，大幅缩短育种的周期，对以果实为主要目的的经济林育种优势尤其明显。分子标记辅助育种离不开有效的分子标记，因此，开发与油茶种仁含油率、油脂品质表型相关的分子标记，对于油茶油脂产量和品质的分子标记辅助育种及相关性状的遗传改良具有重要意义。

果实产量、鲜果出籽率、种仁含油率等指标直接决定单位面积油茶产(油)量。因此，开展油茶种仁含油率研究，是提高油茶产量的重要途径之一，对油茶产业的提升和健康发展具有十分重要的意义。

发明内容

本发明的目的之一在于提供与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记，本发明的另一目的是提供所述SNP分子标记在油茶种仁含油率表型鉴定和育种中的应用。

本发明提供的与油茶种仁含油率关联位点的开发方法是基于油茶是典型的异交物种，连锁不平衡(LD)通常在较小范围内迅速消减，因此可以开展重要性状的LD作图。油茶的种仁全部转录本作为本发明标记开发的区域。在具备产生了大量明显的遗传变异的油茶自然群体的前提下，可有效开展与油茶种仁含油率变异显著相关的标记开发。

本发明中SNP分子标记的开发过程基本如下：

(1)在油茶全分布区内广泛收集油茶种质资源，建立种仁含油率广泛分离的油茶自然群体。

(2)采集自然群体500份油茶种质的完全成熟种子，用索氏抽提法测定种仁含油率。

(3)采集自然群体500个油茶单株的油脂高速合成期的种仁，采用RNAprep Pure多糖多酚植物总RNA提取试剂盒(离心柱型，TIANGEN试剂盒Code No.DP441)提取总RNA，每样本分别构建cDNA文库，利用Illumina HiSeq^TM 4000平台进行二代转录组测序。