[发明专利]环境DNA检测鉴定北太平洋海域柔鱼物种的PCR扩增引物及其检测方法和应用在审
申请号: | 202010490062.0 | 申请日: | 2020-06-02 |
公开(公告)号: | CN111440882A | 公开(公告)日: | 2020-07-24 |
发明(设计)人: | 陈新军;钨倩倩;刘洋;刘必林;王丛丛 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 | 代理人: | 范艳静 |
地址: | 201306 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环境 dna 检测 鉴定 太平洋 海域 物种 pcr 扩增 引物 及其 方法 应用 | ||
1.一种适用于环境DNA检测鉴定北太平洋海域柔鱼物种的PCR扩增引物,其特征在于:上游引物OMBA-F序列为:5’-CGAAGGTTAATCTGTCTCCATCT-3’,下游引物OMBA-R序列为:5’-CCCAATTAAAATTTATATACCACCACCT-3’。
2.权利要求1所述的PCR扩增引物在进行环境DNA检测鉴定北太平洋海域柔鱼物种中的应用,其特征在于:用于检测柔鱼物种的DNA分子标记位点于柔鱼16S基因,DNA扩增片段长度为155bp,DNA序列如SEQ ID NO.1所示,将环境DNA检测结果与DNA分子标记位点序列进行比对,100%匹配即为柔鱼物种。
3.权利要求1所述的PCR扩增引物用于环境DNA检测鉴定北太平洋海域柔鱼物种的检测方法,其特征在于:其包括如下步骤:
(1)采集水样,用孔径为0.4μm的滤膜进行过滤,滤膜于–20℃冷冻保存备用;
(2)通过滤膜进行环境DNA的提取,利用试剂盒提取滤膜上的DNA,提取的环境DNA于–20℃冷冻保存;
(3)利用上游引物OMBA-F和下游引物OMBA-R对步骤(2)中提取的DNA进行PCR扩增,扩增产物用2%的琼脂糖凝胶电泳检测,阳性条带进行DNA片段测序,得到的DNA片段序列与用于鉴定柔鱼物种的DNA分子标记位点序列进行比对,100%匹配为柔鱼物种。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于:所述PCR扩增的20μL反应体系包括:DNA模板2μL,PCR混合液15μL,10μM上下游引物各1μL。
5.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应条件为:50℃,2min→95℃,10min→(95℃,15s→60℃,1min)×55个循环。
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