[发明专利]用于恒温扩增检测甲型肝炎病毒的引物组、荧光试剂盒及方法在审
申请号: | 202010512878.9 | 申请日: | 2020-06-08 |
公开(公告)号: | CN111733285A | 公开(公告)日: | 2020-10-02 |
发明(设计)人: | 曹际娟;郑秋月;朴永哲;杨莉莉 | 申请(专利权)人: | 大连民族大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 北京智为时代知识产权代理事务所(普通合伙) 11498 | 代理人: | 王加岭;杨静 |
地址: | 116600 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 恒温 扩增 检测 肝炎 病毒 引物 荧光 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于恒温扩增检测食品中甲型肝炎病毒的引物组,其特征在于,其包括外引物HAV-OF、HAV-OB,内引物HAV-IF、HAV-IB和环引物HAV-LB,其中,所述HAV-OF的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述HAV-OB的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述HAV-IF的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述HAV-IB的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,所述HAV-LB的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。
2.一种用于恒温扩增检测甲型肝炎病毒的荧光试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括如权利要求1所述的引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括2×恒温扩增反应缓冲液、34×TB Green、BcaBEST酶、AMV逆转录酶。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照为含SEQ ID NO.6所示序列的核苷酸序列的质粒体外转录RNA,所述阴性对照为去核酸的超纯水。
5.一种用于恒温扩增荧光检测甲型肝炎病毒的方法,其特征在于,其包括如下步骤:
S1、从样品中提取RNA;
S2、对步骤S1提取的所述RNA进行等温扩增;其中,在反应体系中,采用核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的外引物HAV-OF、SEQ ID NO.2所示的外引物HAV-OB、SEQ ID NO.3所示的内引物HAV-IF,SEQ ID NO.4所示的内引物HAV-IB、SEQ ID NO.5所示的环引物HAV-LB;
S3、结果判定:
若有“S”型荧光信号扩增曲线,Ct值35,则判断为阳性;
若无“S”型荧光信号扩增曲线,无Ct值或Ct值45则判断为阴性;
若Ct值在35-45之间,建议重复实验,若Ct值45,荧光信号扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,在步骤S2中,所述等温扩增的反应体系采用25μL,含有按终浓度计的1×恒温扩增反应缓冲液,HAV-OF、HAV-OB的终浓度各0.2μM,HAV-IF、HAV-IB的终浓度各1.6μM,HAV-LB的终浓度为0.8μM,BcaBEST酶65U,AMV酶1U,0.34×TB Green及1μL样品RNA模板。
7.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,在步骤S2中,所述等温扩增的反应体系25μL,具体如下:反应总体积为25μL,其中,所述反应体系中含有:2×恒温扩增反应缓冲液12.5μL,34×TB Green 0.25μL,102U/μL BcaBEST酶0.6μL,5U/μL AMV逆转录酶0.2μL,10μM外引物HAV-OF和HAV-OB 0.5μL,40μM内引物HAV-IF和HAV-IB 1μL,20μM环引物HAV-LB和TE缓冲液1μL,RNA模板1.0μL,其余为去核酸的超纯水补足25μL。
8.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,在步骤S2中,所述等温扩增的程序为63℃条件下反应45min。
9.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,在步骤S2中,同时设置以含有如SEQID NO.7所示序列的质粒体外转录RNA为阳性对照,以去核酸的超纯水为空白对照进行检测。
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