[发明专利]基于TaqMan-MGB探针的虾肝肠胞虫荧光定量PCR检测引物组和试剂盒在审
申请号: | 202010524432.8 | 申请日: | 2020-06-10 |
公开(公告)号: | CN111635953A | 公开(公告)日: | 2020-09-08 |
发明(设计)人: | 童桂香;韦信贤;林勇;谭红连;陈秀荔;熊建华;黄光华;杨慧赞;王瑞 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区水产科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 崔自京 |
地址: | 530213 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 taqman mgb 探针 肝肠 荧光 定量 pcr 检测 引物 试剂盒 | ||
本发明公开了基于TaqMan‑MGB探针的虾肝肠胞虫荧光定量PCR检测引物组和试剂盒,属于病毒检测技术领域。具体包括检测虾肝肠胞虫(EHP)的引物和TaqMan‑MGB探针,以及基于上述检测引物和探针的试剂盒、检测方法。本发明设计特异性的引物及TaqMan‑MGB探针,制备了重组质粒标准品pMD18‑T‑SSUEHP,建立检测EHP的TaqMan‑MGB探针荧光定量PCR方法,具有特异性强、灵敏度高、重复性好、定量范围宽及简单快速等优点,适用于虾类样品的EHP定量检测,可为EHP快速定量检测及实时监测提供一种新的技术手段。
技术领域
本发明涉及病毒检测技术领域,更具体地说是涉及基于TaqMan-MGB探针的虾肝肠胞虫荧光定量PCR检测引物组和试剂盒。
背景技术
虾肝肠胞虫(Enterocytozoonhepatopenaei,EHP)属于肠胞虫科、肠胞虫属的一种专性细胞内寄生的微孢子虫,在2004年最早发现于泰国养殖的斑节对虾并于2009年首次被分离和正式命名报道,主要感染凡纳滨对虾和斑节对虾等重要养殖虾类,是近10年危害养殖对虾的主要病原之一。EHP可通过水平和垂直传播,但主要经口摄食寄生EHP的鲜活饵料、病虾、死虾或水体中的孢子体而感染。EHP感染主要导致养殖对虾生长缓慢甚至停滞,表现为对虾消瘦、大小不均、重量离散;还可导致患病虾肝胰腺遭到破坏,免疫力降低,更容易被其他病原所侵染而死亡,给对虾养殖业造成了严重损失。
研究发现,EHP感染数量与其危害密切相关,轻度感染基本上不影响对虾的生长发育,中度感染影响对虾营养吸收,严重感染损坏对虾免疫系统;但轻度感染虾会逐渐发展到重度感染。因此,建立一种快速、准确的EHP定量检测方法,在虾苗检疫、亲虾筛选及成虾养殖疫情监测中可根据EHP定量数据结合虾的大小和养殖模式制定相应的措施,对防控由EHP引起的虾病害具有重要的意义。
EHP感染前期无明显病症,需采用组织学方法或分子生物学方法等实验室手段检测才能确诊。EHP检测方法包括原位杂交、套式PCR、荧光定量PCR和环介导等温扩增(LAMP)等,但是这些方法在灵敏度和便捷程度上各有优缺点;特别是在EHP定量检测方面,目前采用的TaqMan探针定量PCR由于探针长度太长,敏感性不够理想。
目前国内尚未发布EHP检测的相关标准,而农业农村部在虾肝肠胞虫病(EHPD)监测计划中仍推荐采用套式PCR法进行检测。但在实际检测工作中,套式PCR法存在操作繁琐、检测时间长、不能定量等缺点,不能满足对EHP进行快速定量检测的需求。
因此,建立一种基于TaqMan-MGB探针的EHP荧光定量PCR检测方法,以提高EHP定量检测的灵敏度及效率是本领域技术人员亟需解决的问题。
发明内容
有鉴于此,本发明提供了基于TaqMan-MGB探针的虾肝肠胞虫荧光定量PCR检测引物组和试剂盒。
荧光定量PCR相比普通PCR,其检测和分析过程在密闭的单管里由机器自动完成,具自动化程度高、有效解决PCR产物污染问题、能定量检测病原体感染的强弱等优点,在实验室检测病原体的方法选择上被认为是最理想的方法;TaqMan-MGB探针则是荧光定量PCR使用的一种荧光探针,其3′端的淬灭基团为不发光的MGB(Minor Groove Binder)结合物,可实现高Tm值的探针长度缩短易于与模板退火而利于提高方法的灵敏度,且探针3′端不发光的淬灭基团与5′端报告基团在空间的位置更接近,使荧光本底降低、实验结果分辨率更高。
本发明的TaqMan-MGB探针荧光定量PCR法既能发挥荧光定量PCR法的优势而克服套式PCR法的缺点,且其探针连接MGB基团相对于TaqMan探针因长度缩短易于与模板退火而更有利于提高方法的灵敏度,非常适用于对灵敏度要求高的病原体定量检测,可提高EHP检测的敏感性和效率。
为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
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