[发明专利]一种夏南牛HMGA2基因Indel标记的检测方法及应用有效
| 申请号： | 202010550697.5 | 申请日： | 2020-06-16 |
| 公开（公告）号： | CN111560421B | 公开（公告）日： | 2023-05-30 |
| 发明（设计）人： | 陈宏;曹修凯;程杰;王晓刚;黄永震;蓝贤勇;雷初朝 | 申请（专利权）人： | 西北农林科技大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858;C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人： | 范巍 |
| 地址： | 712100 陕*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 夏南牛 hmga2 基因 indel 标记 检测 方法 应用 | ||
1.一种夏南牛HMGA2基因插入缺失突变的检测方法在夏南牛分子育种中的应用，其特征在于：所述夏南牛HMGA2基因插入缺失突变的检测方法，包括以下步骤：
以待测夏南牛基因组DNA为模板，PCR扩增夏南牛HMGA2基因部分片段，对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定夏南牛HMGA2基因插入缺失突变位点的基因型；所述插入缺失突变位点位于牛HMGA2基因chr5:48094736-48094742。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述PCR的扩增引物为：
上游引物：5’-CAGGTGGTGTTCAGATCTGCTCTG-3’；
下游引物：5’-CAGGTTGTCTGAGGTCCATCG-3’。
3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述PCR的扩增体系包括50ng/μL模板DNA1.0μL以及10pmol/L的上、下游引物各1μL。
4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述PCR的扩增反应程序为：95℃预变性5min；94℃变性30s，58℃退火30s，72℃延伸20s，35个循环；72℃延伸10min。
5.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述琼脂糖凝胶电泳采用质量浓度为4％的琼脂糖凝胶。
6.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述插入缺失突变位点的基因型为：插入/插入型表现为112bp的一个条带；插入/缺失型表现为112bp和105bp的两个条带；缺失/缺失型表现为105bp的一个条带。
7.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：在早期分子标记辅助选择中，以所述插入缺失突变位点的基因型为缺失/缺失型的个体形成体型高大的夏南牛种群。
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