[发明专利]一种prep基因缺失型斑马鱼的构建方法有效
申请号: | 202010574627.3 | 申请日: | 2020-06-22 |
公开(公告)号: | CN111575320B | 公开(公告)日: | 2022-11-29 |
发明(设计)人: | 陆辉强;黄勇;廖信军;贾坤;曹子岗;程波;钟科元;马进泽 | 申请(专利权)人: | 赣南师范大学 |
主分类号: | C12N15/90 | 分类号: | C12N15/90;C12N15/85;A01K67/027 |
代理公司: | 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) 61223 | 代理人: | 崔瑞迎 |
地址: | 341000 江西省赣州市蓉江*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 prep 基因 缺失 斑马 构建 方法 | ||
1.prep基因在构建肝脏再生缺陷斑马鱼模型中的应用,其特征在于,所述肝脏再生缺陷斑马鱼模型的构建方法包括如下步骤:
S1、查询斑马鱼prep基因的基因组DNA序列,并分析其功能结构域,根据CRISPR/Cas9敲除原理,在prep基因第3外显子找到prep基因的靶位点,序列为5’-GGTCTCGCACTGCTCCAGGAAGG-3’,并设计靶位点长引物和gRNA接头引物,靶位点长引物序列为5’-TaatacgactcactatagGGTCTCGCACTGCTCCAGGAAGG gttttagagctagaaatagc-3’;gRNA接头引物序列为5’-AGCACCGACTCGGTGCCACTT-3’;
S2、primer star PCR获得gRNA的体外转录模板:
S3、根据S2获得的gRNA的体外转录模板进行体外转录,并提取纯化,获得纯化的gRNA;
S4、将纯化的gRNA和Cas9蛋白显微注射至斑马鱼一细胞期的受精卵,培养获得稳定遗传prep纯合突变斑马鱼品系,即肝脏再生缺陷斑马鱼模型。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于, S2中,反应体系总体积50ul,体系如下:
gRNA cDNA1ul,靶位点长引物1ul,gRNA接头引物1ul,dNTP Mix 4ul,5×Primer starbuffer 10ul,Primer star酶1ul,ddH2O 32ul。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于, S2中,反应程序为:
98℃2min;重复35个循环以下步骤:98℃15s,58℃15s,72℃20s;72℃5min;72℃30min。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于, S3中,反应体系为:
模板DNA10ul,10×RNA polymerase Reaction buffer2ul,25mM rNTP Mix 0.8ul,RNase Inhibitor 0.5ul,T7 RNA polymerase 2ul,RNase free H2O4.7 ul。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于, S3中,反应程序为:
37℃,3小时。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,S4的培养具体包括以下步骤
S1、将显微注射的受精卵培养孵化,Sanger测序检测靶位点的有效性,筛选出有基因突变的,记作F0代,饲养至成鱼;
S2、将F0代成鱼与WT侧交得到F1代;
S3、利用基因型鉴定的方法确定prep基因敲除的F1代突变体;
S4、从F1代突变体中挑选相同突变类型的F1代进行交配得到F2代;
S5、基因型鉴定F2代中prep基因敲除的纯合子即为能稳定遗传prep纯合突变斑马鱼品系,即肝脏再生缺陷斑马鱼模型。
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