[发明专利]一种筛选检测少弱精症相关蛋白标志物的方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202010580098.8 申请日: 2020-06-23
公开(公告)号: CN111707748A 公开(公告)日: 2020-09-25
发明(设计)人: 黄宁;张曼玉;刘晓;孙胜楠;韩超 申请(专利权)人: 山东立菲生物产业有限公司
主分类号: G01N30/02 分类号: G01N30/02;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/36;G01N30/72;G01N30/74;G01N30/88;G01N33/68
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 宋海海
地址: 266000 山东省青岛*** 国省代码: 山东;37
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 筛选 检测 少弱精症 相关 蛋白 标志 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种筛选检测少弱精症相关蛋白标志物的方法,其特征在于,所述方法包括:

(1)提取精子细胞全蛋白;

(2)将精子细胞全蛋白利用基于超滤辅助样品制备方法进行酶解,对酶解后的肽段进行脱盐,制备得到样品混合肽段;

(3)对步骤(2)的样品混合肽段采用高效液相色谱进行分离得各分离样品;

(4)将步骤(3)获得的分离的样品采用纳流液相色谱-串联质谱分析;

(5)对质谱数据进行UNIPROT数据库检索,以检测特异肽段数进行初筛,然后以BSA蛋白信号强度为标准,计算每个样本中蛋白的相对检测丰度;将正常个体与少弱精个体的蛋白按照其相对检测丰度进行筛选,从而得到差异蛋白,从而得到少弱精症相关蛋白标志物。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中,提取精子细胞全蛋白的具体方法包括:

将精子样本采用DPBS洗涤,加入RIPA裂解液超声,置于低温孵育裂解,离心,取上层蛋白质清液,测定清液中蛋白浓度;

优选的,加入RIPA裂解液超声1~2min;

低温孵育裂解具体为:置于冰上孵育20~30min裂解;

离心具体方法为:在12,000~15,000g离心10~30min;优选为14,000g离心20min。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,利用基于超滤辅助样品制备方法对蛋白进行酶解具体为:

在超滤管中加入上述上层蛋白质清液,震荡,离心,加入尿素,继续震荡离心;加入NH4HCO3震荡离心;更换超滤管套管,加入BSA,并加入NH4HCO3溶液,再加入胰蛋白酶,过夜消化。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,对酶解后的肽段进行脱盐采用ziptip法进行。

5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,高效液相色谱分离具体方法为:

样品混合肽段用A相溶解后过柱分离,流动相梯度设置为:0-3min,100%A相,3-25min,流速始终保持为0.7mL/min;紫外检测器UV设置为214nm,根据样品分离的色谱图,在10min时离心管收集液相分离馏分,每管收集1min,并按照收集的时间顺序对组分编号;将组分真空干燥;用乙腈水混合液溶解并交叉合并,将最终得到的组分真空干燥,低温贮存备用;

优选的,过柱采用色谱柱为C18 XBridge BEH-130柱;

优选的,流动相中,

A相:2%CH3CN,98%H2O,NH3H2O调pH 10.0;

B相:98%CH3CN,2%H2O。

6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(4)中,采用纳流液相色谱-串联质谱分析具体方法为:

每个样品分别用A相溶解,样品分离之前分别用A相平衡自制的预柱和分析柱;平衡后样品在A相的带动下首先载样于预柱,然后在不同梯度下进行液相分离;

150min色谱梯度变化如下:5-32%流动相B 100min,32-80%流动相B,20min,80%流动相B,30min.流速始终保持在300nL/min。

质谱检测条件:350-1800m/z的全扫描,分辨率为60,000(m/z 200)。二级图谱扫描时,活化时间为10ms,隔离宽度为2m/z。碎裂方式为诱导碰撞解离,归一化碰撞能量设定为35%,动态排出时间为90s;

纳流液相色谱分离:A相:10%CH3CN,90%H2O,1%甲酸;B相:1%甲酸溶解在90%CH3CN,10%H2O。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于山东立菲生物产业有限公司,未经山东立菲生物产业有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010580098.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top