[发明专利]一种筛选检测少弱精症相关蛋白标志物的方法及其应用在审
申请号: | 202010580098.8 | 申请日: | 2020-06-23 |
公开(公告)号: | CN111707748A | 公开(公告)日: | 2020-09-25 |
发明(设计)人: | 黄宁;张曼玉;刘晓;孙胜楠;韩超 | 申请(专利权)人: | 山东立菲生物产业有限公司 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/36;G01N30/72;G01N30/74;G01N30/88;G01N33/68 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 宋海海 |
地址: | 266000 山东省青岛*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 筛选 检测 少弱精症 相关 蛋白 标志 方法 及其 应用 | ||
1.一种筛选检测少弱精症相关蛋白标志物的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)提取精子细胞全蛋白;
(2)将精子细胞全蛋白利用基于超滤辅助样品制备方法进行酶解,对酶解后的肽段进行脱盐,制备得到样品混合肽段;
(3)对步骤(2)的样品混合肽段采用高效液相色谱进行分离得各分离样品;
(4)将步骤(3)获得的分离的样品采用纳流液相色谱-串联质谱分析;
(5)对质谱数据进行UNIPROT数据库检索,以检测特异肽段数进行初筛,然后以BSA蛋白信号强度为标准,计算每个样本中蛋白的相对检测丰度;将正常个体与少弱精个体的蛋白按照其相对检测丰度进行筛选,从而得到差异蛋白,从而得到少弱精症相关蛋白标志物。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中,提取精子细胞全蛋白的具体方法包括:
将精子样本采用DPBS洗涤,加入RIPA裂解液超声,置于低温孵育裂解,离心,取上层蛋白质清液,测定清液中蛋白浓度;
优选的,加入RIPA裂解液超声1~2min;
低温孵育裂解具体为:置于冰上孵育20~30min裂解;
离心具体方法为:在12,000~15,000g离心10~30min;优选为14,000g离心20min。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,利用基于超滤辅助样品制备方法对蛋白进行酶解具体为:
在超滤管中加入上述上层蛋白质清液,震荡,离心,加入尿素,继续震荡离心;加入NH4HCO3震荡离心;更换超滤管套管,加入BSA,并加入NH4HCO3溶液,再加入胰蛋白酶,过夜消化。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,对酶解后的肽段进行脱盐采用ziptip法进行。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,高效液相色谱分离具体方法为:
样品混合肽段用A相溶解后过柱分离,流动相梯度设置为:0-3min,100%A相,3-25min,流速始终保持为0.7mL/min;紫外检测器UV设置为214nm,根据样品分离的色谱图,在10min时离心管收集液相分离馏分,每管收集1min,并按照收集的时间顺序对组分编号;将组分真空干燥;用乙腈水混合液溶解并交叉合并,将最终得到的组分真空干燥,低温贮存备用;
优选的,过柱采用色谱柱为C18 XBridge BEH-130柱;
优选的,流动相中,
A相:2%CH3CN,98%H2O,NH3H2O调pH 10.0;
B相:98%CH3CN,2%H2O。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(4)中,采用纳流液相色谱-串联质谱分析具体方法为:
每个样品分别用A相溶解,样品分离之前分别用A相平衡自制的预柱和分析柱;平衡后样品在A相的带动下首先载样于预柱,然后在不同梯度下进行液相分离;
150min色谱梯度变化如下:5-32%流动相B 100min,32-80%流动相B,20min,80%流动相B,30min.流速始终保持在300nL/min。
质谱检测条件:350-1800m/z的全扫描,分辨率为60,000(m/z 200)。二级图谱扫描时,活化时间为10ms,隔离宽度为2m/z。碎裂方式为诱导碰撞解离,归一化碰撞能量设定为35%,动态排出时间为90s;
纳流液相色谱分离:A相:10%CH3CN,90%H2O,1%甲酸;B相:1%甲酸溶解在90%CH3CN,10%H2O。
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