[发明专利]唐菖蒲伯克霍尔德氏菌荧光定量PCR内参基因及其引物的筛选和应用有效

专利信息
申请号: 202010595646.4 申请日: 2020-06-28
公开(公告)号: CN111705149B 公开(公告)日: 2022-02-15
发明(设计)人: 李晓丹;汪仁;徐晟;王蓉;江玉梅;周正雄;李宜奎;王松凤 申请(专利权)人: 江苏省中国科学院植物研究所
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/6809;G16B40/00;G16B25/10;G16B25/20;G16B30/10;G16B20/00;G16B20/20;C12R1/01
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 211225 江苏省南京市溧水县白*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 唐菖蒲 霍尔 德氏菌 荧光 定量 pcr 内参 基因 及其 引物 筛选 应用
【权利要求书】:

1.clpXlpxC基因作为内参基因在利用荧光定量PCR检测唐菖蒲伯克霍尔德氏菌毒黄素合成转运相关基因的表达中的应用,其特征在于,所述clpX基因作为培养基不同初始pH值、不同培养时间、不同培养温度和培养基中不同浓度NaCl培养所述唐菖蒲伯克霍尔德氏菌条件下最稳定的内参基因,所述lpxC基因作为培养基中不同浓度NaCl培养所述唐菖蒲伯克霍尔德氏菌条件下最稳定的内参基因;

所述clpX基因的qRT-PCR引物碱基序列为:正向引物clpX-F如SEQ ID NO:5所示,反向引物clpX-R如SEQ ID NO:6所示;

所述lpxC基因的qRT-PCR引物碱基序列为:正向引物lpxC-F如SEQ ID NO:11所示,反向引物lpxC-R如SEQ ID NO:12所示,所述唐菖蒲伯克霍尔德氏菌为菌株HDXY-02和CICC10574,所述菌株HDXY-02的保藏号为CGMCC NO.14054,所述应用为非诊断治疗目的。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,以菌株 HDXY-02和CICC 10574为样本,以毒黄素合成基因簇toxA、toxB、toxC、toxD、toxE基因和转运基因簇toxF、toxG、toxHtoxI为目的基因,以所述clpX基因为内参基因,检测菌株HDXY-02和CICC 10574在培养基不同初始pH值、培养时间、培养温度和培养基中不同浓度NaCl条件下的毒黄素合成转运相关基因的表达。

3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述lpxC作为检测菌株CICC 10574在培养基中不同浓度NaCl条件下毒黄素合成转运相关基因表达的内参基因。

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