[发明专利]一种筛选能将L-氨基酸转化为2-酮酸酶的方法在审
申请号: | 202010616419.5 | 申请日: | 2020-06-30 |
公开(公告)号: | CN111951898A | 公开(公告)日: | 2020-11-17 |
发明(设计)人: | 吴边;李涛;崔雪贤;李瑞峰 | 申请(专利权)人: | 中国科学院微生物研究所 |
主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;G16B30/10;C12P7/40 |
代理公司: | 北京律和信知识产权代理事务所(普通合伙) 11446 | 代理人: | 张羽;武玉琴 |
地址: | 100101 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 筛选 氨基酸 转化 酮酸酶 方法 | ||
1.一种筛选能将L-氨基酸转化为2-酮酸酶的方法,其特征在于,包括如下步骤:
用每个亚家族HMM图谱对最终数据库中的序列进行评分获得E值低于0.001的序列;
得到属于I和II类的15个AT。
2.依据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述最终数据库中的序列的获得方法,包括:
将UniprotKB数据库中源自细菌和古细菌的未被研究的AspAT/ARAT和AlaAT序列下载为数据集,然后对数据集去除冗余序列得最终数据库的序列。
3.依据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述去除冗余序列的方法为去除氨基酸个数>200且与AspAT/ARAT或AlaAT序列的相似度<90%的序列。
4.依据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述HMM亚家族图谱的建立方法,包括:
从Swiss-Port检索已被研究确认的AspAT/ARAT和AlaAT的序列;
对这些序列去除冗余,使用HMMER软件包建立HMM亚家族图谱。
5.依据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述AT用于合成手性非天然氨基酸的方法,包括:
将L-氨基酸通过基于AT的级联反应体系中氧化形成2-酮酸,得2-酮酸反应液;
往2-酮酸反应液中添加0.3mg StDAPDH W121L/H227I或PfNMAADH,0.2mg GDH,1.3当量的葡萄糖和5当量的胺,在pH为8.0-8.5条件下反应。
6.依据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述反应体系的条件为:30℃,200rpm,1mL反应体积。
7.依据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述反应体系成分包括:0.2M磷酸盐缓冲液(pH7.5),30mM L-氨基酸,1mM 2-酮戊二酸,0.25mg/ml ATs,0.1mg/ml LGOX,0.1mg/ml过氧化氢酶和20μM PLP。
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