[发明专利]一种快速构建血浆DNA测序文库的方法和试剂盒在审

专利信息
申请号: 202010641329.1 申请日: 2014-06-24
公开(公告)号: CN111748606A 公开(公告)日: 2020-10-09
发明(设计)人: 陈迪;李亚丽;李天成;石燕滨;张江花;吴凯 申请(专利权)人: 北京贝瑞和康医学检验实验室有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 孟凡宏;谢燕军
地址: 100015 北京市朝阳区京*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 构建 血浆 dna 序文 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.用于构建血浆DNA测序文库的方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)抽提血浆DNA;

2)任选将血浆DNA进行末端补平,获得末端补平后的血浆DNA;

3)将任选末端补平后的血浆DNA进行3’悬A,获得3’悬A后的血浆DNA;

4)将3’悬A后的血浆DNA与测序接头连接,获得连接产物;

5)对连接产物进行纯化,获得纯化产物。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤4)通过选自以下的一种或两种酶来进行:T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述测序接头为双链的测序接头。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述3’悬A采用klenow ex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶与Taq酶的组合。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤2)和3)之间进行纯化步骤;或所述步骤2)和3)在一个反应体系中进行,中间没有纯化步骤。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤2)采用T4DNA聚合酶进行;且所述步骤3)采用Taq酶进行。

7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤3)和4)之间进行纯化步骤;或步骤2)、3)和4)在一个反应体系中进行,中间没有纯化步骤。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述步骤2)采用T4DNA聚合酶进行;所述步骤3)采用Taq酶进行;且所述步骤4)采用T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶进行。

9.用于构建血浆DNA测序文库的试剂盒,其特征在于,包含:

-任选地将血浆DNA进行末端补平的试剂,包括dNTP、用于末端补平的酶、和末端补平缓冲液;

-进行3’悬A的试剂,包括dATP、用于末端悬A的酶、和末端悬A缓冲液;

-与测序接头连接的试剂,包括测序接头、连接酶、和连接缓冲液;和

-对连接产物进行纯化的试剂和装置。

10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述连接酶选自以下中的一种或两种:T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶。

11.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述测序接头为双链的测序接头。

12.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述所述用于末端悬A的酶为klenowex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶与Taq酶的组合。

13.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述用于末端补平的酶为T4 DNA聚合酶。

14.根据权利要求12或13所述的试剂盒,其特征在于,所述用于末端补平的酶为T4 DNA聚合酶;所述用于末端悬A的酶为Taq酶。

15.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述用于末端补平的酶为T4 DNA聚合酶;所述用于末端悬A的酶为Taq酶;用于连接的酶为T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶;且用于连接的接头为双链接头。

16.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述对连接产物进行纯化的试剂选自无菌dH2O或洗脱缓冲液;对连接产物进行纯化的装置选自纯化柱、Qiagen柱、纯化磁珠或Beckman Ampure XP beads。

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