[发明专利]一种快速构建血浆DNA测序文库的方法和试剂盒在审
申请号: | 202010641329.1 | 申请日: | 2014-06-24 |
公开(公告)号: | CN111748606A | 公开(公告)日: | 2020-10-09 |
发明(设计)人: | 陈迪;李亚丽;李天成;石燕滨;张江花;吴凯 | 申请(专利权)人: | 北京贝瑞和康医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 孟凡宏;谢燕军 |
地址: | 100015 北京市朝阳区京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 构建 血浆 dna 序文 方法 试剂盒 | ||
1.用于构建血浆DNA测序文库的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)抽提血浆DNA;
2)任选将血浆DNA进行末端补平,获得末端补平后的血浆DNA;
3)将任选末端补平后的血浆DNA进行3’悬A,获得3’悬A后的血浆DNA;
4)将3’悬A后的血浆DNA与测序接头连接,获得连接产物;
5)对连接产物进行纯化,获得纯化产物。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤4)通过选自以下的一种或两种酶来进行:T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述测序接头为双链的测序接头。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述3’悬A采用klenow ex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶与Taq酶的组合。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤2)和3)之间进行纯化步骤;或所述步骤2)和3)在一个反应体系中进行,中间没有纯化步骤。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤2)采用T4DNA聚合酶进行;且所述步骤3)采用Taq酶进行。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤3)和4)之间进行纯化步骤;或步骤2)、3)和4)在一个反应体系中进行,中间没有纯化步骤。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述步骤2)采用T4DNA聚合酶进行;所述步骤3)采用Taq酶进行;且所述步骤4)采用T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶进行。
9.用于构建血浆DNA测序文库的试剂盒,其特征在于,包含:
-任选地将血浆DNA进行末端补平的试剂,包括dNTP、用于末端补平的酶、和末端补平缓冲液;
-进行3’悬A的试剂,包括dATP、用于末端悬A的酶、和末端悬A缓冲液;
-与测序接头连接的试剂,包括测序接头、连接酶、和连接缓冲液;和
-对连接产物进行纯化的试剂和装置。
10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述连接酶选自以下中的一种或两种:T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶。
11.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述测序接头为双链的测序接头。
12.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述所述用于末端悬A的酶为klenowex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶与Taq酶的组合。
13.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述用于末端补平的酶为T4 DNA聚合酶。
14.根据权利要求12或13所述的试剂盒,其特征在于,所述用于末端补平的酶为T4 DNA聚合酶;所述用于末端悬A的酶为Taq酶。
15.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述用于末端补平的酶为T4 DNA聚合酶;所述用于末端悬A的酶为Taq酶;用于连接的酶为T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶;且用于连接的接头为双链接头。
16.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述对连接产物进行纯化的试剂选自无菌dH2O或洗脱缓冲液;对连接产物进行纯化的装置选自纯化柱、Qiagen柱、纯化磁珠或Beckman Ampure XP beads。
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