[发明专利]人EGFR基因突变的数字PCR检测方法及应用在审
申请号: | 202010671353.X | 申请日: | 2020-07-13 |
公开(公告)号: | CN113930501A | 公开(公告)日: | 2022-01-14 |
发明(设计)人: | 江萤;童慧娟;黄昕 | 申请(专利权)人: | 铭炽生物科技(上海)有限公司;铭时医疗科技(宁波)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 徐迅;高一平 |
地址: | 201304 上海市浦东新区中国(上海)*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | egfr 基因突变 数字 pcr 检测 方法 应用 | ||
1.一种用于检测基因突变的试剂,其特征在于,所述试剂选自下组:
(a)用于检测EGFR S768突变的第一引物对,其中第一引物对包括SEQ ID No:1和2所示的引物;
(b)用于检测EGFR L861突变的第二引物对,其中第二引物对包括SEQ ID No:5和6所示的引物;
(c)用于检测EGFR G719突变的第三引物对,其中第三引物对包括SEQ ID No:9和10所示的引物;
(d)上述(a)、(b)(c)的组合。
2.如权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述试剂还包括:
(a1)与第一引物对配合使用的第一探针,其中所述的第一探针选自下组:SEQ ID No:3所示的探针、SEQ ID No:4所示的探针、或其组合。
3.如权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述试剂还包括:
(b1)与第二引物对配合使用的第二探针,其中所述的第二探针选自下组:SEQ ID No:7所示的探针、SEQ ID No:8所示的探针、或其组合。
4.如权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述试剂还包括:
(c1)与第三引物对配合使用的第三探针,其中所述的第三探针选自下组:SEQ ID No:11所示的探针、SEQ ID No:12所示的探针、SEQ ID No:13所示的探针、SEQ ID No:14所示的探针、或其组合。
5.如权利要求2所述的试剂,其特征在于,所述第一探针的结构(5'-3')如式I所示:
Z1-Z2-Z3 I
其中,
Z1为荧光基团;
Z2为含有锁核苷酸或不含有锁核苷酸的特异性互补核酸序列;
Z3为淬灭基团;
“-”为化学键、连接基团、或1-3个核苷酸构成的接头。
6.如权利要求3所述的试剂,其特征在于,所述第二探针的结构(5'-3')如式II所示:
Z1'-Z2'-Z3'II
其中,
Z1'为荧光基团;
Z2’为含有锁核苷酸或不含有锁核苷酸的特异性互补核酸序列;
Z3'为淬灭基团;
“-”为化学键、连接基团、或1-3个核苷酸构成的接头。
7.如权利要求4所述的试剂,其特征在于,所述第三探针的结构(5'-3')如式III所示:
Z1”-Z2”-Z3”III
其中,
Z1”为荧光基团;
Z2’'为含有锁核苷酸或不含有锁核苷酸的特异性互补核酸序列;
Z3”为淬灭基团;
“-”为化学键、连接基团、或1-3个核苷酸构成的接头。
8.一种试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒含有权利要求1所述的用于检测基因突变的试剂。
9.如权利要求1所述的用于检测基因突变的试剂或权利要求8所述的试剂盒的用途,其特征在于,用于制备一诊断产品,所述诊断产品用于预先评估对象采用EGFR靶向药物的效果。
10.一种检测待测样本是否含有基因突变的方法,其特征在于,包括步骤:
(S1)提供一PCR反应体系,所述PCR反应体系中含有作为模板的待测样本、以及用于扩增的引物对,所述的引物对选自下组:
(a)用于检测EGFR S768突变的第一引物对,其中第一引物对包括SEQ ID No:1和2所示的引物;
(b)用于检测EGFR L861突变的第二引物对,其中第二引物对包括SEQ ID No:5和6所示的引物;
(c)用于检测EGFR G719突变的第三引物对,其中第三引物对包括SEQ ID No:9和10所示的引物;
(d)上述(a)、(b)、(c)的组合;
权利要求1所述的检测基因突变的试剂;
(S2)对步骤(S1)的所述PCR反应体系进行PCR反应,从而获得扩增产物;
(S3)对步骤(S2)中产生的扩增产物进行分析,从而获得所述待测样本是否含有基因突变的分析结果。
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