[发明专利]一种cffDNA非整倍体检测方法、系统、储存介质以及检测设备

权利要求书

1.一种cffDNA非整倍体检测方法，其特征在于，包括以下步骤：

从待测样本中提取cffDNA并构建文库；

对所述文库进行测序获取测序数据；

根据所述测序数据获取目标染色体对应的Zscore值以及双重胎儿浓度；其中，所述双重胎儿浓度用于反映染色体胎儿浓度与标准胎儿浓度的相互关系；

分别对所述Zscore值以及双重胎儿浓度进行阈值比较，根据所述阈值比较结果判断目标染色体的非整倍性。

2.根据权利要求1所述的cffDNA非整倍体检测方法，其特征在于，通过以下公式获取所述双重胎儿浓度：

其中，FF_double表示双重胎儿浓度；FF_Y/X表示标准胎儿浓度，在下标为Y时FF_Y为男胎的Y染色体计算胎儿浓度，在下标为X时FF_X为女胎的估计胎儿浓度；FF_i表示染色体胎儿浓度，下标i表示第i号常染色体染色体。

3.根据权利要求2所述的cffDNA非整倍体检测方法，其特征在于，通过以下公式获取所述染色体胎儿浓度FF_i：

4.根据权利要求2所述的cffDNA非整倍体检测方法，其特征在于，通过以下公式获取所述男胎的Y染色体计算胎儿浓度FF_Y：

5.根据权利要求2所述的cffDNA非整倍体检测方法，其特征在于，通过以下步骤获取所述女胎的估计胎儿浓度FF_X：

建立参考集，根据参考集数据获取所述男胎的Y染色体计算胎儿浓度FF_Y；

屏蔽X染色体以及Y染色体，对其它染色体的数据进行连续切割得到长度为50kb的bin，获取在每个bin中测序片段的数目；

基于所有样本中所有bin的测序片段数与所述男胎的Y染色体计算胎儿浓度FF_Y一一对应关系建立弹性网络模型拟合参数模型；

以所述弹性网络模型拟合参数模型，根据待检测样本中所有bin的测序片段获取所述女胎的估计胎儿浓度FF_X。

6.根据权利要求1所述的cffDNA非整倍体检测方法，其特征在于，所述Zscore值的阳性阈值为3，所述双重胎儿浓度的阳性阈值为1；当所述Zscore值大于3且所述双重胎儿浓度小于等于1时，目标染色体的非整倍体判断为阳性，否则判断为阴性。

7.根据权利要求1所述的cffDNA非整倍体检测方法，其特征在于，在对所述文库进行测序获取测序数据的步骤中，包括以下步骤：

对所述文库进行片段富集；

对片段富集后的所述文库进行测序获取测序数据。

8.一种cffDNA非整倍体检测系统，其特征在于，包括：

文库构建模块，用于从待测样本中提取cffDNA并构建文库；

测序模块，用于对所述文库进行测序获取测序数据；

Zscore值以及双重胎儿浓度获取模块，用于根据所述测序数据获取目标染色体对应的Zscore值以及双重胎儿浓度；其中，所述双重胎儿浓度用于反映染色体胎儿浓度与标准胎儿浓度的相互关系；

阈值比较判断模块，用于分别对所述Zscore值以及双重胎儿浓度进行阈值比较，根据所述阈值比较结果判断目标染色体的非整倍性。

9.一种储存介质，其上储存有计算机程序，其特征在于：所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7任一项所述的cffDNA非整倍体检测方法。

10.一种cffDNA非整倍体检测设备，其特征在于：包括储存介质、处理器以及储存在所述储存介质中并可被所述处理器执行的计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7任一项所述的cffDNA非整倍体检测方法。