[发明专利]一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒及其方法在审
申请号: | 202010685803.0 | 申请日: | 2020-07-16 |
公开(公告)号: | CN111690752A | 公开(公告)日: | 2020-09-22 |
发明(设计)人: | 韩勋领;罗锋;孙松松;李红玉 | 申请(专利权)人: | 重庆浦洛通基因医学研究院有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851 |
代理公司: | 重庆智慧之源知识产权代理事务所(普通合伙) 50234 | 代理人: | 余洪 |
地址: | 400711 重庆市北碚*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 人类 egfr 基因突变 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:包括用于人类表皮生长因子受体EGFR基因G719A、G719S、G719C、E746_A750I、E746_A750del(1)、E746_A750del(2)、L747_T751del1、L747_T751del2、E746_A750A、E746_S752A、E746-S752V、E746-S752D、E746_A750del、L747_P753S、L747_S752del、L747_T751S、L747_T751P、L747_A750P1、L747-A750P2、L747_P753Q、L747-T751Q、L747_E749del、T790M、S768I、V769_D770insASV、H773_V774insH、D770_N771insG、L858R、L861Q等29种突变的引物、探针,内控基因引物和探针、外控基因引物和探针。
2.如权利要求1所述一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述人类EGFR基因29中突变的引物和探针分为7个引物体系。
3.如权利要求2所述一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:引物体系1包括用于检测G719A、G719S、G719C位点的引物和探针,引物体系2包括用于检测E746_A750I/E746_A750del(1)、E746_A750del(2)/L747_T751del1、L747_T751del2/E746_A750A、E746_S752A/E746-S752V、E746-S752D/E746_A750del、L747_P753S/L747_S752del、L747_T751S/L747_T751P、L747_A750P1/L747-A750P2、L747_P753Q/L747-T751Q、L747_E749del位点的引物和探针,引物体系3包括用于检测T790M位点的引物和探针,引物体系4包括用于检测S768I位点的引物和探针,引物体系5包括用于检测V769_D770insASV、H773_V774insH、D770_N771insG位点的引物和探针,引物体系6包括用于检测L858R位点的引物和探针,引物体系7包括用于检测L861Q位点的引物和探针。
4.如权利要求1-3中任一项所述一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述人类EGFR基因29中突变的引物和探针序列如SEQ IQ NO.1-SEQ IQ NO.34所示。
5.如权利要求1所述一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述人类EGFR基因外控基因引物和探针序列如SEQ IQ NO.35-SEQ IQ NO.37所示。
6.如权利要求1所述一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述人类EGFR基因内控基因引物和探针序列如SEQ IQ NO.38-SEQ IQ NO.40所示。
7.如权利要求1所述一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括荧光定量PCR反应缓冲液,dNTPs,热启动DNA Polymerase,阴性对照品和阳性对照品。
8.一种根据权利要求1-7中任一项所述检测人类EGFR基因突变的试剂盒的使用方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)核酸提取:根据样本类型(外周血/石蜡包埋组织)选择不同的商业化试剂盒进行DNA提取,本发明中外周血DNA提取采用美基生物生产的HiPure Blood DNA Mini Kit试剂盒,石蜡包埋组织DNA提取采用HiPure FFPE DNA Kit试剂盒;
2)PCR反应体系的配置:预混分装荧光定量PCR反应缓冲液,dNTPs,热启动DNAPolymerase形成PCR反应液,然后将步骤1)得到的DNA及引物体系1-7、外控基因引物探针体系分别加入PCR反应液中分别形成PCR反应体系1-PCR反应体系8,共同组成PCR反应体系;混匀后瞬离5s,进行PCR扩增;
3)反应结束后进行基因分型判读。
9.如权利要求8所述一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒的使用方法,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增的条件为:
预变性的条件为:95℃,2min;
第一阶段由5个扩增循环构成,其条件为:95℃,15s;58℃,1min;
第二阶段由40个扩增循环构成,其条件为:95℃,15s;60℃,1min,并于60℃分别采集FAM(靶点)、VIC(内参)荧光通道的信号。
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