[发明专利]一种气单胞菌属内不同物种的条形码鉴定引物、鉴定方法和试剂盒有效
申请号: | 202010692281.7 | 申请日: | 2020-07-17 |
公开(公告)号: | CN111926094B | 公开(公告)日: | 2022-07-22 |
发明(设计)人: | 李梅;许承佳;李丹;林森馨;陈发明;李天宇;杨呈勇;刘贻尧;吴国锋;潘育方 | 申请(专利权)人: | 电子科技大学中山学院;中山市动物疫病预防控制中心(中山市动物卫生技术中心) |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6869;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 528402 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 气单胞菌属内 不同 物种 条形码 鉴定 引物 方法 试剂盒 | ||
1.一种气单胞菌属不同物种的条形码鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
A、提取待测气单胞菌基因组DNA;
B、使用条形码鉴定引物进行PCR扩增,产物经琼脂糖凝胶电泳检测合格后进行测序;
C、将待测PCR产物序列作BLAST比对分析,以序列覆盖度大于98%且相似度大于98.8%作为筛选标准,GenBank数据库中满足此条件的物种与待测物种为同一物种;
所述的条形码鉴定引物为:F:5’-GGAATTCGCAACCGTTCTGGCTCAGGCTATCGT-3’;R:5’-TGTCGACGACGGCAGCCACTTTCAC-3’。
2.根据权利要求1所述的条形码鉴定方法,其特征在于,从GenBank上下载气单胞菌属代表种的cpn60序列,与待测序列一起构建系统发育树,聚为同一最小分支具有最高的同源性。
3. 根据权利要求1所述的条形码鉴定方法,其特征在于,所述的进行PCR扩增是:50μl的PCR反应体系,体系成分为:ddH2O 40μl、10×PCR Buffer 5μl、10mM的dNTPs 1μl、10μM的引物-F 1μl、10μM的引物-R 1μl、DNA模板1μl、2U/μl 的Taq DNA聚合酶1μl;PCR扩增条件为:94℃预变性5min;94℃变性30s、退火温度49℃,退火时间为30s、72℃延伸1min、共30个循环;72℃再延伸10min。
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