[发明专利]用于肝癌患者抗肿瘤免疫应答的个体化的可视化展示方法

权利要求书

1.一种用于肝癌患者抗肿瘤免疫应答的个体化的可视化展示方法，其特征在于，包括：

采集肿瘤组织及与其匹配的血细胞样本，分离出肿瘤组织DNA和RNA、血细胞DNA；

对肿瘤组织RNA进行全转录组测序，得到全转录组测序数据；

根据所述全转录组测序数据对以下七个免疫循环参数进行评估，包括：按照人类基因组进行序列比对，对所述肿瘤组织RNA的转录组进行组装，计算基因表达量TPM值，采用基因集变异分析对所述七个免疫循环参数进行评估；所述七个免疫循环参数包括：T细胞免疫、致敏及活化、趋化及浸润、识别肿瘤细胞、抑制细胞、免疫检查点分子表达和抑制分子表达；

对所述肿瘤组织DNA和所述血细胞DNA进行全外显子测序，得到全外显子测序数据；

根据所述全外显子测序数据和所述全转录组测序数据，预测肿瘤新生抗原负荷，包括：对所述全外显子测序数据进行HLA分型处理得到HLA分型结果；根据所述全外显子测序数据和所述全转录组测序数据鉴定出样本中的突变型抗原肽；对所述突变型抗原肽与其匹配的HLA分子的亲和力进行分析，预测肿瘤新生抗原负荷；

通过八个维度的基因参数表示抗肿瘤免疫循环，并对所述八个维度的基因参数采用雷达图进行可视化展示，其中所述八个维度的基因参数包括：T细胞免疫、肿瘤新生抗原负荷、致敏及活化、趋化及浸润、识别肿瘤细胞、抑制细胞、免疫检查点分子表达和抑制分子表达。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在所述雷达图中以逆时针顺序展示所述八个维度的基因参数。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对所述全外显子测序数据进行HLA分型处理的步骤，包括：

选择6号染色体HLA分子全外显子测序数据，对HLA I型基因进行分型处理，并对得到的HLA分型结果进行确认分析。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，对所述突变型的抗原肽其匹配的HLA分子的亲和力进行分析的步骤，包括：

计算突变型抗原肽的基因表达值，所述基因表达值大于预设值的突变型抗原肽为新生抗原负荷。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述预设值为1.6TPM。