[发明专利]一种基于云架构的基因测序订单处理方法、系统及介质在审

专利信息
申请号: 202010714959.7 申请日: 2020-07-23
公开(公告)号: CN111968705A 公开(公告)日: 2020-11-20
发明(设计)人: 李斌;钱志荣 申请(专利权)人: 北斗生命科学(广州)有限公司;钱志荣
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B50/00;G16B45/00
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 胡辉
地址: 510000 广东省广州市黄埔区开源大*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 架构 基因 订单 处理 方法 系统 介质
【权利要求书】:

1.一种基于云架构的基因测序订单处理方法,其特征在于,包括以下步骤:

获取基因测序订单,提取所述基因测序订单中的患者信息;根据所述患者信息进行样本采集,其中,所述样本采集这一过程包括以下至少一个步骤:采集新样本或选择历史样本;

上传所述患者信息以及样本,并将所述患者信息与所述样本进行关联,构建样本数据库;从所述样本数据库中通过轮询策略提取样本进行基因测序,生成测序结果报告,根据所述测序结果报告更新报告数据库;

根据所述患者信息,得到所述测序结果报告。

2.根据权利要求1所述的一种基于云架构的基因测序订单处理方法,其特征在于,所述方法还包括以下步骤:

根据所述基因测序订单,生成订单记录以及支付路径;

根据所述支付路径的反馈,更新所述订单记录,根据更新后的订单记录生成支付结果。

3.根据权利要求1所述的一种基于云架构的基因测序订单处理方法,其特征在于,所述从所述样本数据库中通过轮询策略提取样本进行基因测序这一步骤中,所述基因测序包括以下至少一个步骤:苏木精—伊红染色、核酸提取、高通量测序以及实时荧光定量PCR。

4.根据权利要求2所述的一种基于云架构的基因测序订单处理方法,其特征在于,所述生成测序结果报告这一步骤,包括以下步骤:

根据所述患者信息,结合所述支付结果,生成请求消息并发送至消息队列;

根据所述消息队列的输出,生成测序结果报告。

5.根据权利要求1-4任一项所述的一种基于云架构的基因测序订单处理方法,其特征在于,所述构建样本数据库这一步骤,其具体为:

根据所述患者信息以及所述样本,生成第一样本数据库;复制所述第一样本数据库得到第二样本数据库。

6.根据权利要求5所述的一种基于云架构的基因测序订单处理方法,其特征在于,所述复制所述第一样本数据库得到第二样本数据库这一步骤,包括以下步骤:

将所述第一样本数据中的记录转换为二进制日志事件;将所述二进制日志事件复制到第二样本数据库中的中继日志;

根据所述患者信息以及所述样本更新所述中继日志。

7.一种基于云架构的基因测序订单处理系统,其特征在于,包括用户服务模块、基因测序模块、数据资源模块;

所述用户服务模块,用于获取用户信息和基因测序订单,以及下载测序结果报告

所述基因测序模块;用于通过轮询策略提取样本进行基因测序,生成测序结果报告,根据所述测序结果报告更新报告数据库;

所述数据资源模块,用于根据患者信息进行样本采集,其中,所述样本采集这一过程包括以下至少一个步骤:采集新样本或选择历史样本;上传所述患者信息以及样本,并将所述患者信息与所述样本进行关联,构建样本数据库;还用于根据测序结果报告更新报告数据库。

8.一种基于云架构的基因测序订单处理系统,其特征在于,所述系统还包括订单处理模块,用于根据所述基因测序订单,生成订单记录以及支付路径;根据所述支付路径的反馈,更新所述订单记录,根据更新后的订单记录生成支付结果。

9.一种基于云架构的基因测序订单处理系统,其特征在于,包括:

至少一个处理器;

至少一个存储器,用于存储至少一个程序;

当所述至少一个程序被所述至少一个处理器执行,使得所述至少一个处理器实现如权利要求1-6任一项所述的一种基于云架构的基因测序订单处理方法。

10.一种存储介质,其中存储有处理器可执行的程序,其特征在于:所述处理器可执行的程序在由处理器执行时用于实现如权利要求1-6中任一项所述的一种基于云架构的基因测序订单处理方法。

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