[发明专利]一种基于云架构的基因测序订单处理方法、系统及介质

说明书

本发明的提供了一种基于云架构的基因测序订单处理方法、系统及介质，方法包括以下步骤：获取基因测序订单，提取基因测序订单中的患者信息；根据患者信息进行样本采集，其中，上传患者信息以及样本，并将患者信息与样本进行关联，构建样本数据库；从样本数据库中通过轮询策略提取样本进行基因测序，生成测序结果报告，根据测序结果报告更新报告数据库；根据患者信息，得到测序结果报告；方法能够实现方便、快捷地按需获取和释放计算资源，能快速获取资源从而提高订单处理效率，并能够高并发处理业务订单；此外通过本方法可替换大量的人工操作，节约资源成本同时提高时效性，并避免人为因素导致的错误操作，可广泛应用于云计算技术领域。

技术领域

本发明涉及云计算技术领域，尤其是一种基于云架构的基因测序订单处理方法、系统及介质。

背景技术

随着云计算的普及，越来越多的企业或用户选择将生产实践等行为，迁移到云服务提供商的云计算平台，运行在云计算平台上，成为云用户。云架构可以根据业务的具体需求为其分配计算、存储、带宽等资源，即云资源。但在目前订单服务的过程中，尤其是类似在基因测序等体外诊断的领域中，仍然采用普通的订单管理平台或系统工具。传统的订单管理平台所能处理的业务量小，如需要对平台的业务量进行扩充，则需要消耗大量的计算资源；而且对系统或平台的计算资源的调度能力要求极高，对于计算资源的投入成本极高。

发明内容

有鉴于此，为至少部分解决上述技术问题之一，本发明实施例目的在于提供一种基于云架构，能对抗高并发的基因测序订单处理方法，以及可以对应实现基于云架构的基因测序订单处理方法的系统以及存储介质。

第一方面，本发明的提供了一种基于云架构的基因测序订单处理方法，包括以下步骤：

获取基因测序订单，提取基因测序订单中的患者信息；根据患者信息进行样本采集，其中，样本采集这一过程包括以下至少一个步骤：采集新样本或选择历史样本；

上传患者信息以及样本，并将患者信息与样本进行关联，构建样本数据库；

从样本数据库中通过轮询策略提取样本进行基因测序，生成测序结果报告，根据测序结果报告更新报告数据库；根据患者信息，得到测序结果报告。

在本发明的一些实施例中，方法还包括以下步骤：根据基因测序订单，生成订单记录以及支付路径；根据支付路径的反馈，更新订单记录，根据更新后的订单记录生成支付结果；根据支付结果，从样本数据库中通过轮询策略提取样本进行基因测序，生成测序结果报告，根据测序结果报告更新报告数据库。

在本发明的一些实施例中，从样本数据库中通过轮询策略提取样本进行基因测序这一步骤中，基因测序包括以下至少一个步骤：苏木精—伊红染色、核酸提取、高通量测序以及实时荧光定量PCR。

在本发明的一些实施例中，生成测序结果报告这一步骤，其包括：根据患者信息，结合支付结果，生成请求消息并发送至消息队列；根据消息队列的输出，生成测序结果报告。

在本发明的一些实施例中，构建样本数据库这一步骤，其具体为：根据患者信息以及样本，生成第一样本数据库；复制第一样本数据库得到第二样本数据库。

在本发明的一些实施例中，复制第一样本数据库得到第二样本数据库这一步骤，其包括：将第一样本数据中的记录转换为二进制日志事件；将二进制日志事件复制到第二样本数据库中的中继日志；根据患者信息以及样本更新中继日志。

第二方面，本发明的技术方案还提供一种基于云架构的基因测序订单处理系统，包括用户服务模块、基因测序模块以及数据资源模块，其中：

用户服务模块，用于获取用户信息和基因测序订单，以及下载测序结果报告；

基因测序模块；用于通过轮询策略提取样本进行基因测序，生成测序结果报告，根据测序结果报告更新报告数据库；