[发明专利]一种利用CRISPR-Cas9靶向敲除鸡Bmp4基因的方法在审

专利信息
申请号: 202010734335.1 申请日: 2020-07-27
公开(公告)号: CN111778289A 公开(公告)日: 2020-10-16
发明(设计)人: 李碧春;高雯;左其生;张晨;袁霞;姜景译;丁颖;张亚妮;孙红艳 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12N15/90 分类号: C12N15/90;C12N15/867
代理公司: 扬州苏中专利事务所(普通合伙) 32222 代理人: 沈志海
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 利用 crispr cas9 靶向 bmp4 基因 方法
【权利要求书】:

1.一种利用CRISPR-Cas9靶向敲除鸡Bmp4基因的方法,其特征是,包括:

1)Bmp4-sgRNA敲除载体构建及慢病毒包裹;

2)Bmp4-sgRNA敲除载体活性验证;

3)T7E1酶切检测Bmp4基因敲除效率;

4)TA克隆测序检测Bmp4基因敲除效率。

2.根据权利要求1所述的一种利用CRISPR-Cas9靶向敲除鸡Bmp4基因的方法,其特征是,所述步骤1):

根据NCBI官网公布的Bmp4基因的CDS区序列信息以及https://zlab.bio/guide-design-resources网站上提供的的敲除靶点设计原则设计Bmp4基因第一外显子区的3个sgRNA靶位点,并分别合成相应的寡聚单链DNA,同时设置阴性对照sg-NC序列;

接着,将寡聚单链DNA退火后形成的双链片段插入到CRISPR-Cas9敲除载体骨架PGMLV-GM1上,以构建Bmp4基因的3个敲除载体;为改善敲除载体转染效率低、作用时间短缺陷,选择阳性重组质粒进行慢病毒包裹及Lentivirus滴度测定。

3.根据权利要求2所述的一种利用CRISPR-Cas9靶向敲除鸡Bmp4基因的方法,其特征是,所述步骤2):

为验证Bmp4基因3个sgRNA载体的敲除活性,采用两步转染法将双载体(LentiCas9-Blast和sgRNA病毒载体)转染至生长状态良好的DF-1细胞;首先转染LentiCas9-Blast,用含有杀稻瘟菌素Blast的培养基筛选2周,收集存活的细胞进行第二次转染(sgRNA),同时用Blast和嘌呤霉素Puro筛选2周。

4.根据权利要求3所述的一种利用CRISPR-Cas9靶向敲除鸡Bmp4基因的方法,其特征是,所述步骤3):

收集筛选后的阳性细胞提取基因组,扩增Bmp4基因靶序列片段,回收PCR扩增产物进行T7E1酶切检测,通过灰度值计算基因敲除效率。

5.根据权利要求4所述的一种利用CRISPR-Cas9靶向敲除鸡Bmp4基因的方法,其特征是,所述步骤4):

设计特异性引物扩增靶点区段序列进行TA克隆测序,计算基因敲除效率。

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