[发明专利]基于CRISPR技术的核酸检测的信号放大磁珠技术系统及其应用有效

专利信息
申请号: 202010793936.X 申请日: 2020-08-10
公开(公告)号: CN111850097B 公开(公告)日: 2021-04-16
发明(设计)人: 郑敦武 申请(专利权)人: 苏州顶点生物医药有限公司
主分类号: C12Q1/682 分类号: C12Q1/682;C12Q1/6844;C12Q1/70;C12Q1/40
代理公司: 南京行高知识产权代理有限公司 32404 代理人: 肖念
地址: 215400 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 crispr 技术 核酸 检测 信号 放大 系统 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种基于CRISPR技术的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括信号放大磁珠技术系统和等温扩增引物;所述信号放大磁珠技术系统包含报告磁珠,所述报告磁珠由羧基修饰的磁珠、ssDNA和链霉亲和素标记的β-半乳糖苷酶组成,所述ssDNA分子的两端分别用氨基和生物素标记,所述报告磁珠具体结构为磁珠(羧基)/5’氨基-AATGGCAAATGGCA-3’Bio/SA_β-Gal,所述的报告磁珠的构建方法包括以下步骤:将磁珠与ssDNA通过共价键方式连接得到ssDNA-磁珠,通过链霉亲和素和生物素将β-半乳糖苷酶和ssDNA-磁珠连接得到;所述等温扩增引物包括RPA-F引物:GGTTATGGCTGTAGTTGTGATCAACTCCGC,RPA-R 引物:GATGTCAAAAGCCCTGTATACGACATCAGTAC;所述检测试剂盒还包括Cas12a蛋白和crRNA,所述crRNA 序列为:AGACGGGCUGCACUUACACCG。

2.一种基于CRISPR技术的超高灵敏度核酸检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)将病毒液进行热灭活和裂解,释放病毒的RNA分子,使用纳米核酸磁珠提取病毒悬液中RNA分子,将提取磁珠加入RT-PRA等温扩增的反应体系中,对靶分子进行RT-RPA扩增,获得第一级的信号扩大;所述病毒液为假病毒液,所述假病毒为2019-nCOV假病毒;所述RT-RPA等温扩增采用的引物包括RPA-F引物:GGTTATGGCTGTAGTTGTGATCAACTCCGC,RPA-R 引物:GATGTCAAAAGCCCTGTATACGACATCAGTAC;

2)将第一级的信号扩大获得的DNA分子使用原来的纳米磁珠进行第二次提取,并将DNA分子加入到包含具备旁切割活性的Cas12a蛋白的反应体系中特异性识别切割病毒靶DNA分子,并激活Cas12a蛋白的非特异切割活性,启动第二级的信号放大,其中与Cas12a蛋白结合的crRNA序列为:AGACGGGCUGCACUUACACCG;

3)在反应体系中加入报告磁珠:磁珠(羧基)/5’氨基-AATGGCAAATGGCA-3’Bio/SA_β-Gal,具备旁切割活性的Cas12a非特异切断ssDNA释放游离的β-半乳糖苷酶到体系上清中,使用磁铁吸附所有的磁珠,取出含有游离β-半乳糖苷酶的上清加入荧光底物反应,使用酶标仪进行读数检测,得出检测荧光信号;

其中,所述报告磁珠由羧基修饰的磁珠、ssDNA和链霉亲和素标记的β-半乳糖苷酶组成,所述ssDNA分子的两端分别用氨基和生物素标记,所述报告磁珠具体结构为磁珠(羧基)/5’氨基-AATGGCAAATGGCA-3’Bio/SA_β-Gal,所述的报告磁珠的构建方法包括以下步骤:将磁珠与ssDNA通过共价键方式连接得到ssDNA-磁珠,通过链霉亲和素和生物素将β-半乳糖苷酶和ssDNA-磁珠连接得到。

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