[发明专利]一种SARS-CoV-2病毒核酸检测的引物组、试剂盒及其应用有效
申请号: | 202010813271.4 | 申请日: | 2020-08-13 |
公开(公告)号: | CN112029903B | 公开(公告)日: | 2021-11-16 |
发明(设计)人: | 马立新;王飞;何如怡;翟超;杨军;刘洋;余晓;刘琳琳 | 申请(专利权)人: | 湖北大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 | 代理人: | 丁倩 |
地址: | 430062 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 sars cov 病毒 核酸 检测 引物 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括靶向目的基因SARS-CoV-2的N基因和/或ORF1ab基因的向导DNA,其中:
所述N基因的向导DNA为如SEQ ID NO.5所示的单链DNA分子;
所述ORF1ab基因的向导DNA为SEQ ID NO.6所示的单链DNA分子。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括用于扩增SARS-CoV-2的N基因和/或ORF1ab基因的引物组、针对SARS-CoV-2的N基因和/或ORF1ab基因的带有荧光标记的分子信标和PfAgo酶。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述引物组中用于扩增N基因的引物对包括引物NF和引物NR;
所述引物NF为如SEQ ID NO.1所示的单链DNA分子;
所述引物NR为如SEQ ID NO.2所示的单链DNA分子;
所述引物组中用于扩增ORF1ab基因的引物对包括引物OF和引物OR;
所述引物OF为如SEQ ID NO.3所示的单链DNA分子;
所述引物OR为如SEQ ID NO.4所示的单链DNA分子。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述针对SARS-CoV-2的N基因的分子信标中的核酸序列为如SEQ ID NO.7所示的单链DNA分子;
所述针对SARS-CoV-2的ORF1ab基因的分子信标中的核酸序列为如SEQ ID NO.8所示的单链DNA分子。
5.如权利要求2-4任一项所述试剂盒的制备方法,其特征在于,为如下(1)或(2):
(1)所述引物组、所述向导DNA、所述分子信标和所述PfAgo酶单独包装;
(2)所述引物组、所述向导DNA、所述分子信标和所述PfAgo酶按比例混合在一起。
6.如权利要求1-4任一项所述的试剂盒在鉴定或辅助鉴定新型冠状病毒SARS-CoV-2的非疾病诊断和治疗目的上的用途。
7.一种鉴定或辅助鉴定新型冠状病毒SARS-CoV-2的非疾病诊断和治疗目的的方法,其特征在于,包括如下步骤:以待测病毒的cDNA为模板,采用如权利要求2-4任一项所述的试剂盒进行检测;如检测到的荧光值高于阴性对照、待测病毒为候选的新型冠状病毒SARS-CoV-2,如果不满足上述条件、待测病毒为候选的非新型冠状病毒SARS-CoV-2。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
S1、以待测样本中的核酸提取液为模板,采用如权利要求2中所述的引物组进行逆转录PCR对新型冠状病毒SARS-CoV-2的待检测区域进行扩增;
S2、将权利要求1中所述的向导DNA、权利要求2中所述的分子信标和PfAgo酶与所述S1步骤得到的PCR扩增产物混合,进行酶切反应;
S3、检测上述反应体系中所述分子信标切割后产生的荧光情况,若荧光值与阴性对照相比有显著差异,则判断PCR产物中含有新型冠状病毒SARS-CoV-2的特异性扩增产物,从而推断样品中含有SARS-CoV-2病毒;若荧光值与阴性对照相比没有显著差异,则判断PCR产物中不含有新型冠状病毒SARS-CoV-2的特异性扩增产物,从而推断样品中不含有SARS-CoV-2病毒。
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