[发明专利]单核苷酸多态性位点在制备代谢相关因素的遗传风险评分系统中的应用

说明书

本发明提供了一种单核苷酸多态性位点在制备代谢相关因素的遗传风险评分(GRS)系统中的应用。本发明人通过整合多个单核苷酸多态性位点的遗传变异信息，提供了一种遗传风险评分方法以及系统。本发明的方法获得的遗传风险分数能够作为判断个体对膳食胆固醇敏感性的指标之一，从而为个体的膳食选择提供指导，以及用于进行代谢性亚健康状态或代谢性疾病评估。

技术领域

本发明属于单核苷酸多态性分析领域，更具体地，本发明涉及单核苷酸多态性位点在制备代谢相关因素的遗传风险评分系统中的应用。

背景技术

在全球许多发达国家和发展中国家，血液胆固醇水平异常一方面是导致一些人群处于亚健康状态的因素之一，另一方面其也是心血管疾病、阿尔茨海默症和癌症等疾病的关键危险因素之一。

血液胆固醇水平异常主要表现为总胆固醇(Total Cholesterol，TC)、低密度胆固醇(Low Density Lipoprotein Cholesterol，LDL-C)水平较高和高密度胆固醇(HighDensity Lipoprotein Cholesterol，HDL-C)水平较低。根据最近一份汇集200个国家，超过1亿成年人的报告估计，2017年全球因为非HDL-C水平较高导致的死亡人数为390万，其中一半发生在非HDL-C水平增加较快的亚洲国家中。人体中的胆固醇有两种来源，其中约30％来自饮食摄入，约70％来自肝脏的从头合成。

一些研究表明，饮食和生活方式因素，遗传变异和药物可能会单独或共同影响血浆胆固醇的水平。考虑到多数研究并未发现膳食胆固醇摄入量与循环胆固醇水平之间有明显较强的联系，美国、中国等多个国家的居民膳食指南取消了饮食胆固醇的限制。然而，不同人群和个体之间血液胆固醇水平对饮食胆固醇摄入的反应差异较大，遗传易感性可能部分解释了异质性。

最近的一些研究结果确定了一些与血液胆固醇水平相关的遗传位点，不乏一些参与胆固醇的生物合成、吸收和外排的基因。研究表明，NPC1L1等基因上的单核苷酸多态性位点(Single Nuclear Polymorphism，SNP)可以改变胆固醇摄入与血浆胆固醇水平的关系。

尽管许多基因参与维持胆固醇稳态的复杂调控，但到目前为止，大多数研究仅局限于单个或几个SNP的作用，很少有研究系统地评估多种遗传变异对饮食胆固醇摄入与血浆胆固醇之间关系的整体影响。因此，找到合适的分析方法来对个体对膳食胆固醇的敏感程度进行评价以及精准膳食干预方案的制定具有十分重要的意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种单核苷酸多态性位点在制备评估膳食胆固醇敏感性、代谢性亚健康状态或代谢性疾病的检测系统中的应用。

本发明的目的还在于提供一种进行遗传风险评分的方法，所述方法用于代谢性亚健康状态或代谢性疾病评估。

在本发明的第一方面，提供单核苷酸多态性位点在制备用于膳食胆固醇敏感性、代谢性亚健康状态或代谢性疾病评估的检测系统(如检测试剂、检测试剂盒或检测装置)中的应用，所述单核苷酸多态性位点通过以下方式获得：(1)选择(包括初步选择)与血浆TC，LDL-C或HDL-C水平显著相关的单核苷酸多态性位点；(2)从(1)的位点中选择MAF≥1％且缺失率10％的单核苷酸多态性位点。

在一个优选例中，所述选择或初步选择可包括：根据统计学有意义数量的人群进行基因分析后获得(包括初步获得)的血浆TC，LDL-C或HDL-C水平显著相关的单核苷酸多态性位点；或根据现有技术数据库提供的相关人群的基因信息/单核苷酸多态性信息而获得的。

在另一优选例中，所述应用为用于总胆固醇(TC)水平相关的评估。

在另一优选例中，所述应用为用于低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平相关的评估。

在另一优选例中，所述应用为用于高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平相关的评估。