[发明专利]一种构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的引物组及其应用有效
| 申请号： | 202010829545.9 | 申请日： | 2020-08-18 |
| 公开（公告）号： | CN112143777B | 公开（公告）日： | 2022-07-01 |
| 发明（设计）人： | 宋瑾;郭静雅;任树成;张恒辉;沈宁;孔雅娴 | 申请（专利权）人： | 北京臻知医学科技有限责任公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6806 | 分类号： | C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京中珒知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11806 | 代理人： | 王中;张硕 |
| 地址： | 102600 北京市大兴区中关村科技园区大*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 构建 tcr cdr3 通量 序文 引物 及其 应用 | ||
1.一种引物组在制备用于构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的产品或制备用于肿瘤或病原体抗原特异性TCR鉴定的产品中的应用，其特征在于，所述引物组的上游引物包括TRBV10-1-F、TRBV10-2/3-F、TRBV11-1/2/3-F、TRBV12-3.1/4/5.1-F、TRBV12-3.2/5.2-F、TRBV13-F、TRBV14-F、TRBV15-F、TRBV16-F、TRBV18-F、TRBV19-F、TRBV20-F、TRBV24-F、TRBV25-F、TRBV27-F、TRBV28-F、TRBV29-F、TRBV2-F、TRBV3-F、TRBV30-F、TRBV4-1-F、TRBV4-2/3-F、TRBV5-1-F、TRBV5-4/5/6/8-F、TRBV6-1-F、TRBV6-2/3-F、TRBV6-4.1-F、TRBV6-4.2-F、TRBV6-1.2/5/8-F、TRBV6-1.1/6/7/9-F、TRBV7-1-F、TRBV7-2/4/6/7/8-F、TRBV7-3-F、TRBV7-9-F和TRBV9-F；
其中，TRBV10-1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；TRBV10-2/3-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；TRBV11-1/2/3-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；TRBV12-3.1/4/5.1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；TRBV12-3.2/5.2-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；TRBV13-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；TRBV14-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示；TRBV15-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示；TRBV16-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；TRBV18-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示；TRBV19-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示；TRBV20-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示；TRBV24-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示；TRBV25-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示；TRBV27-F的核苷酸序列如SEQ IDNO.15所示；TRBV28-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示；TRBV29-F的核苷酸序列如SEQ IDNO.17所示；TRBV2-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示；TRBV3-F的核苷酸序列如SEQ IDNO.19所示；TRBV30-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.20所示；TRBV4-1-F的核苷酸序列如SEQID NO.21所示；TRBV4-2/3-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.22所示；TRBV5-1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.23所示；TRBV5-4/5/6/8-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.24所示；TRBV6-1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.25所示；TRBV6-2/3-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.26所示；TRBV6-4.1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.27所示；TRBV6-4.2-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.28所示；TRBV6-1.2/5/8-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.29所示；TRBV6-1.1/6/7/9-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.30所示；TRBV7-1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.31所示；TRBV7-2/4/6/7/8-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.32所示；TRBV7-3-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.33所示；TRBV7-9-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.34所示和TRBV9-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.35所示；
所述引物组的下游引物包括TRBJ1-1-R、TRBJ1-2-R、TRBJ1-3-R、TRBJ1-4-R、TRBJ1-5-R、TRBJ1-6-R、TRBJ2-4-R、TRBJ2-1-R、TRBJ2-2-R、TRBJ2-3-R、TRBJ2-5-R、TRBJ2-6-R和TRBJ2-7-R；
其中，TRBJ1-1-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.36所示；TRBJ1-2-R的核苷酸序列如SEQID NO.37所示；TRBJ1-3-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.38所示；TRBJ1-4-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.39所示；TRBJ1-5-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.40所示；TRBJ1-6-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.41所示；TRBJ2-4-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.42所示；TRBJ2-1-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.43所示；TRBJ2-2-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.44所示；TRBJ2-3-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.45所示；TRBJ2-5-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.46所示；TRBJ2-6-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.47所示；TRBJ2-7-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.48所示。
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