[发明专利]一种肺肿瘤组织DNA中SHOX2基因甲基化检测方法在审
申请号: | 202010835371.7 | 申请日: | 2020-08-19 |
公开(公告)号: | CN112501288A | 公开(公告)日: | 2021-03-16 |
发明(设计)人: | 李小花;刘朝煜;王俊;姚旭梅 | 申请(专利权)人: | 深圳思凝一云科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京中南长风知识产权代理事务所(普通合伙) 11674 | 代理人: | 郑海 |
地址: | 518101 广东省深圳市宝安区新*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 肿瘤 组织 dna shox2 基因 甲基化 检测 方法 | ||
1.一种肺肿瘤组织DNA中SHOX2基因甲基化检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)对待检测肺癌肿瘤组织DNA样本进行亚硫酸盐修饰处理;
2)亚硫酸盐处理后的DNA、20%,40%,60%,80%,100%甲基化标准品DNA、SHOX2特异性PCR检测引物、SHOX2特异性探针、内参基因引物和内参基因探针进行RT-PCR反应;
3)测量肺肿瘤组织DNA、20%,40%,60%,80%,100%甲基化标准品DNA的Ct值。
2.根据权利要求1所述的肺肿瘤组织DNA中SHOX2基因甲基化检测方法,其特征在于,所述SHOX2特异性PCR检测引物的S-M-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述内参基因特异性PCR检测引物的A-M-F的核苷酸序列如SEQ ID No:2所示。
3.根据权利要求2所述的肺肿瘤组织DNA中SHOX2基因甲基化检测方法,其特征在于,所述SHOX2特异性PCR检测引物的S-M-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述内参基因特异性PCR检测引物的A-M-R的核苷酸序列如SEQ ID No:4所示。
4.根据权利要求3所述的肺肿瘤组织DNA中SHOX2基因甲基化检测方法,其特征在于,所述SHOX2特异性探针的S-M-P的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,所述内参基因特异性探针的A-M-P的核苷酸序列如SEQ ID No:6所示。
5.根据权利要求4所述的肺肿瘤组织DNA中SHOX2基因甲基化检测方法,其特征在于,所述qRT-PCR反应的反应方法,包括以下步骤:
1)在95℃下保持3分钟;
2)降温至58℃,保持20秒;
3)升温至72℃,保持30秒;
4)将步骤2)和步骤3)进行50次循环;
5)在72℃下保持1分钟。
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