[发明专利]与西伯利亚杏开花期早晚相关的标记及其检测引物、方法与应用

说明书

本发明公开与西伯利亚杏开花期早晚相关的标记及其检测引物、方法与应用，在西伯利亚杏的6号染色体中存在与西伯利亚杏花期早晚相关7个SNP标记，设计与检测西伯利亚杏花期早晚的6对引物，通过6对引物进行PCR扩增，检测西伯利亚杏的6号染色体中与西伯利亚杏花期早晚相关的标记位点，并测序标记位点的基因型，从而判定西伯利亚杏花期早晚。通过对我国西伯利亚杏的全基因组关联分析发现位点与西伯利亚杏开花期早晚显著相关，并进一步针对该位点开发标记，提供检测西伯利亚杏开花期早晚的方法及专用引物，本发明提供的引物可以特异检测西伯利亚杏中位点的基因型,也可以作为不同花期育种中的标记辅助选择的新工具，具有非常重要的积极意义。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域。具体地说是与西伯利亚杏开花期早晚相关的标记及其检测引物、方法与应用。

背景技术

西伯利亚杏是一种多年生核果树种，其广泛分布于中国北部和西北部，蒙古的西部和西南部，西伯利亚的西部和俄罗斯的沿海等地。西伯利亚杏适应性强，是一种集生态价值和经济价值于一身的优良生态兼经济树种。西伯利亚果仁中脂肪、蛋白质及苦杏仁苷含量丰富，杏仁可以入药，也可以榨油或加工成食品与饮料，是中国传统的出口物资之一。但西伯利亚杏产量不稳定，多受天气状况的影响：早春的大风和低温影响蜜蜂的活动和授粉情况，霜冻也会减少花芽，花和幼果的数量。因此，晚花性状是西伯利亚杏的重要育种目标，鉴定晚花性状紧密相关的分子标记和基因，通过分子育种手段针对性选育晚花性状，开发一种早期检测西伯利亚杏花期的分子标记，可为西伯利亚杏在分子鉴定和辅助育种等方面提供有力的技术支持，具有重要的理论和应用价值。

发明内容

为此，本发明所要解决的技术问题在于提供一种可以特异检测西伯利亚杏中位点的基因型的与西伯利亚杏开花期早晚相关的标记及其检测引物、方法与应用。

为解决上述技术问题，本发明提供如下技术方案：

与西伯利亚杏开花期早晚相关的标记，在西伯利亚杏的6号染色体中存在与西伯利亚杏花期早晚相关7个SNP标记，分别为

Ps-FT-SNP1：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18103769位点；

Ps-FT-SNP2：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18103787位点；

Ps-FT-SNP3：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18104140位点；

Ps-FT-SNP4：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18105050位点；

Ps-FT-SNP5：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18106369位点；

Ps-FT-SNP6：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18106638位点；

Ps-FT-SNP7：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18107219位点。

上述与西伯利亚杏开花期早晚相关的标记，Ps-FT-SNP1：位于西伯利亚杏的6号染色体上的第18103769位点的突变基因为G/A；

Ps-FT-SNP2：位于西伯利亚杏的6号染色体的上第18103787位点的突变基因为G/A；

Ps-FT-SNP3：位于西伯利亚杏的6号染色体的上第18104140位点的突变基因为T/A；

Ps-FT-SNP4：位于西伯利亚杏的6号染色体的上第18105050位点的突变基因为T/G；

Ps-FT-SNP5：位于西伯利亚杏的6号染色体的上第18106369位点的突变基因为G/A；

Ps-FT-SNP6：位于西伯利亚杏的6号染色体的上第18106638位点的突变基因为T/C；