[发明专利]用于小片段核酸纯化筛选的方法在审
申请号: | 202010872689.2 | 申请日: | 2020-08-26 |
公开(公告)号: | CN111926060A | 公开(公告)日: | 2020-11-13 |
发明(设计)人: | 李新;马玉;信秀青;李瑞强;赵桂仿 | 申请(专利权)人: | 天津诺禾致源生物信息科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 梁文惠 |
地址: | 301700 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 片段 核酸 纯化 筛选 方法 | ||
1.一种用于小片段核酸纯化筛选的方法,其特征在于,包括以下步骤:利用核酸纯化磁珠通过控制PEG8000和异丙醇百分比浓度配比进行第一轮纯化,收取磁珠上清液回收N nt以下的核酸片段,其中,N100。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:利用核酸纯化磁珠通过控制PEG8000和异丙醇百分比浓度配比对所述磁珠上清液进行第二轮纯化,回收所述核酸纯化磁珠上所吸附的核酸片段,所述核酸片段的长度大于M nt,NM。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,调整PEG8000百分比浓度在6%~7.5%之间,异丙醇百分比浓度在31%~35%之间,采用XP磁珠进行所述第一轮纯化,吸附65nt及65nt以上的核酸片段,收取磁珠上清液回收65nt以下核酸片段。
4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,调整PEG8000百分比浓度在6%-8.5%之间,异丙醇浓度在38%~41%之间,采用XP磁珠进行第二轮纯化,吸附45nt及45nt以上的核酸片段。
5.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其特征在于,对获取的核酸片段进行凝胶电泳验证。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述第一轮纯化之前还包括:
核酸样本起始量的确定:设计不同长度的单链DNA序列,制备25~95nt不同长度DNA的混合液,评估预定基础磁珠体积、预定PEG8000和异丙醇的百分比浓度条件下核酸样本最佳起始量。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,在所述第一轮纯化之前还包括:固定异丙醇百分比浓度,设置不同PEG8000百分比浓度,评估PEG8000对小片段核酸纯化的效果,确定合适的核酸片段长度范围。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,固定异丙醇百分比浓度为35%。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,在所述第一轮纯化之前还包括:评估适合小片段核酸纯化的PEG8000和异丙醇百分比浓度配比。
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