[发明专利]一种嗜酸性PGPR菌株的筛选、鉴定及其生防活性方法在审
申请号: | 202010880875.0 | 申请日: | 2020-08-27 |
公开(公告)号: | CN112280703A | 公开(公告)日: | 2021-01-29 |
发明(设计)人: | 王杰;雷霆;王静;罗倩茜;丁忠林;舒芳靖;姚峰;喻延;苟正贵;何孝磊 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院烟草研究所;贵州省烟草公司黔南州公司 |
主分类号: | C12N1/20 | 分类号: | C12N1/20;C12N1/02;C12Q1/18;C12Q1/37;C12Q1/34;C12Q1/44;C12Q1/689;C12Q1/6869;C12Q1/04;G01N21/31;A01N63/22;A01P1/00;A01P21/00;C12R1/125 |
代理公司: | 重庆百润洪知识产权代理有限公司 50219 | 代理人: | 陈万江 |
地址: | 266010 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 酸性 pgpr 菌株 筛选 鉴定 及其 活性 方法 | ||
1.一种嗜酸性PGPR菌株的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一:嗜酸性PGPR菌株筛选
(1)将营养琼脂培养基平板pH调为5.5进行嗜酸细菌的筛选;
(2)根际土样悬浮液不做80℃热处理。
步骤二:不同酸碱度条件下菌株抑菌活性测定
(1)供试菌株发酵液制备如下:将活化的菌株接种于1.1中不同pH的NB中,28℃、150r/min振荡培养24h后在紫外分光光度计下调整浓度为108CFU/mL、不同pH条件的标准菌液。
(2)不同酸碱度条件下菌株发酵液抑菌活性测定
琼脂扩散法测定菌株发酵液抑菌活性:取对数期108CFU/mL青枯菌菌液均匀喷雾平板,琼脂孔中加入50μL菌株发酵液,阴性对照为等量相同pH的NB培养基,28℃培养48h后观察,十字交叉法测量抑菌带宽度。
(3)酸性条件下菌株无菌滤液对青枯菌抑制作用
无菌滤液制备:菌株标准菌液按体积比1%分别接种于pH5.5的NB中,28℃、150r/min振荡培养48h后的发酵液低温条件下5000r/min离心5min后,上清液经细菌过滤器除菌获得无菌滤液。
(4)琼脂扩散法测定菌株无菌滤液抑菌活性:取对数期108CFU/mL青枯菌菌液均匀喷雾平板,琼脂孔中加入50μL菌株无菌滤液,阴性对照为等量相同pH的NB培养基,28℃培养48h后观察,十字交叉法测量抑菌带宽度。
(5)菌株无菌滤液对菌体的影响采用透射电镜观察法:分别取10mL菌株无菌滤液与1mL青枯菌发酵液混合培养,空白对照是10mLNB培养基,每个处理3个重复。
2.根据权利要求1所述的一种嗜酸性PGPR菌株的筛选方法,其特征在于:经酸性平板初筛试验的抑菌圈大小获得抑菌活性较好的10株拮抗细菌;拮抗活性最好菌株17。
3.根据权利要求1所述的一种嗜酸性PGPR菌株的筛选方法,其特征在于:通过菌体和无菌上清液拮抗活性和稳定性重复试验,获得拮抗活性和稳定性最强的菌株17,其发酵液和无菌上清液均对青枯菌较好的抑制效果,抑菌带宽分别为9.39±1.67amm和7.00±1.00amm。
4.一种嗜酸性PGPR菌株的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一:BIOLOG鉴定
将菌株鉴定培养基上33℃培养24h,按照操作规程将微生物细胞浓度调至90%~98%T,将菌悬液倒入V型加样水槽中,用8通道电动移液器按每孔100μL的量将菌悬液按顺序加入微孔板的所有孔中,33℃黑暗培养,在培养4~6h和16~24h时用读数仪读取菌株的特征性碳源代谢指纹特征,结果与BIOLOG数据库中的菌株进行比对分析,获得鉴定结果。
步骤二:分子鉴定
按照细菌基因组提取试剂盒操作步骤提取菌株基因组DNA,采用16SrDNA通用引物27F/1492R进行PCR扩增,PCR反应条件:94℃5min;94℃1min,56℃1min,72℃90s,35次循环;72℃7min,PCR扩增产物交由上海派森诺生物科技股份有限公司测序,将16SrDNA基因序列,进行序列分析和系统发育树构建。
5.根据权利要求1所述的一种嗜酸性PGPR菌株的鉴定方法,其特征在于:BIOLOG鉴定,BIOLOG板微孔菌株代谢测定结果显示,培养24h后,菌株能利用a-D-葡萄糖、D-山梨醇、L-丙氨酸、甘油、L-天门冬氨酸、柠檬酸、L-谷氨酸和蔗糖,该菌株代谢特征与枯草芽孢杆菌相似度较高,其可能性、相似性和位距分别为0.960、0.66和5.051,为枯草芽孢杆菌。
6.根据权利要求1所述的一种嗜酸性PGPR菌株的鉴定方法,其特征在于:菌株16SrDNA基因序列长度为1417bp,在GenBank中分别进行BLAST同源性比对,基于16SrDNA基因序列构建2个菌株系统发育树,菌株与枯草芽孢杆菌B.subtilis同源性为99.0%。
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