[发明专利]PNA在检测DNA裂解片段中的应用在审
申请号: | 202010882833.0 | 申请日: | 2020-08-28 |
公开(公告)号: | CN112522377A | 公开(公告)日: | 2021-03-19 |
发明(设计)人: | 叶盛;李思慧;朱晓玲;徐涛;梁兴国;方志俊;申志发;小宫山真 | 申请(专利权)人: | 浙江原创医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/6886;C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 常州佰业腾飞专利代理事务所(普通合伙) 32231 | 代理人: | 李嘉宁 |
地址: | 325000 浙江省温州市瓯海区*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | pna 检测 dna 裂解 片段 中的 应用 | ||
1.PNA在检测DNA裂解片段中的应用。
2.一种定性检测DNA裂解片段的方法,其步骤包括:
(1)设计引物组和PNA探针组序列,所述引物组和PNA探针组的核苷酸序列部分重叠,重叠部分与待检测的DNA裂解片段的端部核酸序列互补;PNA探针和扩增引物重叠序列的碱基数为9至11个,;
(2)以待测样品为模板,加入引物组和PNA探针组进行PCR反应,然后电泳查看结果,能观察到核酸条带说明存在待检测的DNA裂解片段。
3.根据权利要求2所述的定性检测DNA裂解片段的方法,其特征在于:所述引物组的引物为单碱基错配引物,错配位点位于PNA探针和核酸扩增引物重叠序列的中间。
4.一种实时检测DNA裂解片段的方法,其步骤包括:
(1)设计引物组、PNA探针组和TaqMan MGB探针序列,所述引物组和PNA探针组的核苷酸序列部分重叠,重叠部分包括待检测的DNA裂解片段的端部核酸序列;
(2)以待测样品为模板,加入引物组、PNA探针组、TaqMan MGB探针进行荧光定量PCR,标准曲线法进行定量分析,分析扩增结果。
5.根据权利要求4所述的实时检测DNA裂解片段的方法,其特征在于:所述引物组的引物为单碱基错配引物,错配位点位于PNA探针和核酸扩增引物重叠序列的中间。
6.一组用于定性检测SRY基因裂解片段的引物和PNA探针组合,包括:
SRY-PNA-F:H2N-AAAGCTGTAACTCTA-CONH2
SRY-PF1m:CTGTAAATCTAAGTATCAGTGTG
SRY-PNA-R:H2N-TCCCAGCTGCTTGCT-CONH2
SRY-PR1m:AGCTGCATGCTGATCTCTGAG。
7.一组用于实时检测SRY基因裂解片段的引物和PNA、TaqMan探针组合,包括:
SRY-PNA-F:H2N-AAAGCTGTAACTCTA-CONH2
SRY-PF1m:CTGTAAATCTAAGTATCAGTGTG
SRY-PNA-R:H2N-TCCCAGCTGCTTGCT-CONH2
SRY-PR1m:AGCTGCATGCTGATCTCTGAG
TaqMan-MGB-SRY:AAGCGACCCATGAA。
8.一组用于定性检测Maspin基因裂解片段的引物和PNA探针组合,包括:
Maspin-PNA-F:H2N-CCAACGTGTCTGAGA-Lys-CONH2
Maspin-PF1m:GTGTCAGAGAAATTTGTAGTGTTAC
Maspin-PNA-R:H2N-CATACGTACAGACAT-Lys-CONH2
Maspin-PR1m:GTACAAACATGCGTACGGC。
9.一组用于实时检测Maspin基因裂解片段的引物和PNA、TaqMan探针组合,包括:
Maspin-PNA-F:H2N-CCAACGTGTCTGAGA-Lys-CONH2
Maspin-PF1m:GTGTCAGAGAAATTTGTAGTGTTAC
Maspin-PNA-R:H2N-CATACGTACAGACAT-Lys-CONH2
Maspin-PR1m:GTACAAACATGCGTACGGC
TaqMan-MGB-Maspin:CGAATATTTCACCTTCC。
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