[发明专利]一种快速鉴定二倍体T0 在审
申请号: | 202010893587.9 | 申请日: | 2020-08-31 |
公开(公告)号: | CN112176084A | 公开(公告)日: | 2021-01-05 |
发明(设计)人: | 闫晓红;吴刚;赵圣博;罗君玲 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院油料作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 薛红凡 |
地址: | 430062 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 二倍体 base sub | ||
1.一种快速鉴定二倍体T0代基因编辑作物双等位基因纯合突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)以二倍体T0代基因编辑作物的DNA为模板,在靶标编辑位点下游设计特异性引物,进行PCR扩增,得PCR产物;
(2)对所述PCR产物进行变性和复性后,与T7E1酶混合后,在37℃孵育30min,终止反应,电泳后只有一个条带的为野生型或双等位基因纯合突变植株PCR产物;
(3)将待检测野生型或双等位基因纯合突变植株植株的PCR产物与已知野生型植株的PCR产物等量混合后变性和复性,与T7E1酶混合后,在37℃孵育30min,终止反应,电泳后只有一个条带表示待检测植株为野生型,电泳后有三个条带表示待检测植物为双等位基因纯合突变植株。
2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(1)在靶标编辑位点下游500~800bp处设计特异性引物。
3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(1)所述PCR扩增的反应体系以20μl计算,包括:模板1μl,10mM dNTPs 0.5μl,上下游引物各0.5μl,10×Ex TaqBuffer2μl,Ex Taq0.1μl,余量为水。
4.根据权利要求1或3所述方法,其特征在于,步骤(1)所述PCR扩增的反应程序包括:94℃预变性1min;94℃变性30s,56℃退火40s,72℃延伸1min,35个循环;72℃延伸10min。
5.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(2)所述变性和复性的反应体系包括:10×NEBuffer22μl,待检测植株的PCR产物4μl和Nuclease-free Water 13.5μl。
6.根据权利要求1或5所述方法,其特征在于,步骤(2)所述变性和复性的反应程序包括:95℃5min;90℃30s,85℃1s,每个循环降0.1℃,600个循环;4℃保存。
7.根据权利要求6所述方法,其特征在于,经过所述变性和复性的PCR产物与T7E1酶的体积比为19.5:0.5。
8.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(3)所述变性和复性的反应体系包括:10×NEBuffer 22μl,野生型或双等位基因纯合突变植株PCR产物2μl,待检测植株PCR产物2μl和Nuclease-free Water 13.5μl。
9.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(2)和步骤(3)中所述终止反应,均包括向所述孵育后的孵育液中加入0.25M的EDTA水溶液。
10.根据权利要求9所述方法,其特征在于,所述孵育液与EDTA水溶液的体积比为20:1.5。
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