[发明专利]烟草黑胫病预警基因Ntab0278480及其应用有效
申请号: | 202010896092.1 | 申请日: | 2020-08-31 |
公开(公告)号: | CN111961744B | 公开(公告)日: | 2022-06-03 |
发明(设计)人: | 魏攀;谢小东;王燃;李锋;金立锋;董臣;杨军;罗朝鹏;王中;武明珠 | 申请(专利权)人: | 中国烟草总公司郑州烟草研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/29;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州联科专利事务所(普通合伙) 41104 | 代理人: | 张晓萍 |
地址: | 450001 *** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 烟草 黑胫病 预警 基因 ntab0278480 及其 应用 | ||
1.烟草黑胫病预警基因Ntab0278480,其特征在于,其碱基序列如SEQ ID No.2所示,具体如下:
GTTTAGAACTCGGCAGCGTTTCGATACGTTCGTACGCTTTCGATATCGTCAGAGACGAAATAAGAAATCGGCTCATTCCACTTTTAGAAAGTAACCAGAATGGCACCGTTTTGGATTTGCAAGATGTTTTTAGGCGATTCTCGTTTGATAGTATATGTAAATTCTCTTTTGGAATGGATCCGGGTTGCTTG。
2.权利要求1所述烟草黑胫病预警基因Ntab0278480在烟草黑胫病防治中应用,其特征在于,作为预警基因用于指示黑胫病的感染情况。
3.针对权利要求1所述烟草黑胫病预警基因Ntab0278480的检测用PCR引物,其特征在于,具体引物序列为:
Ntab0278480-F:5’-GTTTAGAACTCGGCAGCGTT-3’,
Ntab0278480-R:5’-CAAGCAACCCGGATCCATTC-3’。
4.利用权利要求3所述检测用PCR引物所制备的qRT-PCR检测试剂盒。
5.如权利要求4所述qRT-PCR检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括检测参考基因L25用引物,具体引物序列为:
L25-F:5’-CCCCTCACCACAGAGTCTGC-3’,
L25-R:5’-AAGGGTGTTGTTGTCCTCAATCTT-3’。
6.利用权利要求3所述检测用PCR引物的烟草黑胫病检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(一)提取待检烟叶样品总RNA,并反转录cDNA;
(二)以正常生长未感染烟株烟叶样品作为对照,以L25为参考基因,利用Ntab0278480-F/R引物对进行qRT-PCR检测,计算Ntab0278480的相对表达量;
所述参考基因L25,为利用如下引物序列PCR扩增所得基因:
L25-F:5’-CCCCTCACCACAGAGTCTGC-3’,
L25-R:5’-AAGGGTGTTGTTGTCCTCAATCTT-3’;
(三)依据步骤(三)中表达量情况判定待检样品黑胫病感染情况,具体而言:
相较于对照组,如果Ntab0278480的相对表达量变化不具有统计学意义,则表明待检样品未感染黑胫病;
如果Ntab0278480的相对表达量升高低于1.5倍,则需停留不少于6h后重新检测判定;
如果Ntab0278480的相对表达量升高不低于1.5倍,则按照如下情况判定黑胫病发病阶段;
。
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