[发明专利]一种基于罗氏沼虾转录组序列开发的引物组及其应用有效
| 申请号： | 202010926645.3 | 申请日： | 2020-09-07 |
| 公开（公告）号： | CN111979341B | 公开（公告）日： | 2021-08-06 |
| 发明（设计）人： | 李喜莲;陈雪峰;顾志敏;高强;张宇飞;慎佩晶;徐洋;蒋文枰;徐宾朋;程海华;彭菲;黄振远 | 申请（专利权）人： | 浙江省淡水水产研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11;G16B20/20 |
| 代理公司： | 北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙) 11562 | 代理人： | 张换君 |
| 地址： | 313001 浙*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 基于 罗氏沼虾 转录 序列 开发 引物 及其 应用 | ||
1.一种基于罗氏沼虾转录组序列开发的引物组，其特征在于，所述引物组由8对SSR引物组成，其核苷酸序列如SEQ ID No.1～16所示。
2.一种权利要求1所述的引物组合物在鉴评罗氏沼虾遗传多样性中的应用。
3.一种鉴评罗氏沼虾遗传多样性的方法，其特征在于，包括如下步骤：
(1)取待分析罗氏沼虾的DNA；
(2)将SEQ NO.1～16所示引物组的5’端标记FAM；
(3)以步骤(1)待测品DNA为模板，利用步骤(2)所述5’端标记FAM后的SEQ NO.1～16所示引物组进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；
(4)将步骤(3)得到的PCR扩增产物进行毛细管电泳检测，统计每对单位点引物扩增的等位基因数目，得到统计结果；
(5)记录每对引物的扩增峰型，对获得的数据进行分析处理，评价罗氏沼虾种质的遗传多样性。
4.根据权利要求3所述的鉴评罗氏沼虾遗传多样性的方法，其特征在于：步骤(1)中，提取分析罗氏沼虾的DNA时，以罗氏沼虾的腹部肌肉组织作为提取样本。
5.根据权利要求3所述的鉴评罗氏沼虾遗传多样性的方法，其特征在于，所述PCR的扩增体系为DNA模板1μl、上游引物0.1μl、下游引物0.3μl、2*GoldStar Best MasterMix 5μl和水3.6μl。
6.根据权利要求3所述的鉴评罗氏沼虾遗传多样性的方法，其特征在于，所述PCR的扩增程序为95℃，5min，95℃30s、45-60℃30s、72℃30s共15个循环，95℃30s、50℃30s、72℃30s共20个循环，72℃7min。
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