[发明专利]棉花果节长短分子标记及其应用

权利要求书

1.TagSNP-6400827在鉴定或辅助鉴定棉花果节长短中的应用；所述TagSNP-6400827是棉花基因组的一个SNP位点，所述TagSNP-6400827是位于棉花第D01号染色体上SEQ IDNo.1的第147位核苷酸，其为A或T。

2.检测棉花基因组中TagSNP-6400827的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定棉花果节长短产品中的应用；所述TagSNP-6400827是棉花基因组的一个SNP位点，TagSNP-6400827是位于棉花第D01号染色体上SEQ ID No.1的第147位核苷酸，其为A或T。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述检测棉花基因组中TagSNP-6400827的多态性或基因型的物质为扩增包括TagSNP-6400827在内的棉花基因组DNA片段的引物对。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述引物对为引物对A1，引物对A1是由SEQID No.2所示的单链DNA和SEQ ID No.3所示的单链DNA组成的引物对。

5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述引物对为引物对A2，引物对A2是由SEQID No.4所示的单链DNA和SEQ ID No.5所示的单链DNA组成的引物对。

6.鉴定或辅助鉴定棉花果节长短的方法，包括检测待测棉花基因型，根据待测棉花的基因型鉴定或辅助鉴定待测棉花是短果节棉花还是长果节棉花：AA基因型的待测棉花为或候选为短果节棉花；TT基因型和AT基因型的待测棉花为或候选为长果节棉花；所述AA基因型是棉花基因组中权利要求1中所述TagSNP-6400827为A的纯合型，所述TT基因型是棉花基因组中权利要求1中所述TagSNP-6400827为T的纯合型，所述AT基因型是棉花基因组中权利要求1中所述TagSNP-6400827为A和T的杂合型。

7.权利要求2中所述检测棉花基因组中TagSNP-6400827的多态性或基因型的物质或权利要求6所述的方法在棉花育种中的应用，所述棉花育种为培育短果节棉花品种。

8.棉花的育种方法，包括：检测待选棉花基因组中权利要求1中所述TagSNP-6400827的基因型，选择棉花基因组中权利要求1中所述TagSNP-6400827的基因型为AA或AT的待选棉花作为亲本进行育种。

9.根据权利要求8所述的棉花的育种方法，其特征在于：所述选择棉花基因组中所述TagSNP-6400827的基因型为AA或AT的待选棉花作为亲本，包括如下X1和/或X2：

X1、以待选棉花的基因组DNA为模板，用引物对A1扩增得到PCR产物，测序获得待选棉花基因型；

X2、以待选棉花的基因组DNA为模板，用引物对A2扩增得到PCR产物，检测所述PCR产物的大小。

10.下述1)-3)中任一种产品：

1)SEQ ID No.1所示的DNA分子；

2)扩增棉花基因组中包括SEQ ID No.1的第147位核苷酸在内的DNA片段的引物对；

3)由SEQ ID No.2所示的单链DNA和SEQ ID No.3所示的单链DNA组成的引物对A1；

4)由SEQ ID No.4所示的单链DNA和SEQ ID No.5所示的单链DNA组成的引物对A2。