[发明专利]棉花果节长短分子标记及其应用在审
申请号: | 202010945742.7 | 申请日: | 2020-09-10 |
公开(公告)号: | CN112063741A | 公开(公告)日: | 2020-12-11 |
发明(设计)人: | 张永山;陈伟;姚金波;李燕;房圣涛;朱守鸿 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院棉花研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 莫舒颖 |
地址: | 455000 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 棉花 长短 分子 标记 及其 应用 | ||
本发明公开了棉花果节长短相关的SNP分子标记及其应用。该应用具体可为TagSNP‑6400827在鉴定或辅助鉴定棉花短果节基因中的应用;所述TagSNP‑6400827是棉花基因组的一个SNP位点,TagSNP‑6400827是位于棉花第D01号染色体上SEQ ID No.1的第147位核苷酸,其为A或T。实验证明,基因型AA的的棉花品种的果节长度均短于4cm,说明本发明的TagSNP‑6400827是棉花短果节基因相关的SNP分子标记。而TagSNP‑基因型AA或基因型AT的棉花单株作为亲本均有选育得到基因型AA棉花品种的可能,可用于棉花分子标记辅助选择育种,用于短果节棉花的选育。
技术领域
本发明涉及生物技术领域中棉花果节长短分子标记及其应用。
背景技术
当前,提高棉花产量、适应机械采收、降低生产成本是棉花生产的研究方向。作物株型是作物的多个农艺性状在整体水平上的综合体现,是决定作物产量和机械收获性状的重要因素。在棉花、玉米等不同作物中都提出了理想株型的概念,朱绍琳通过实验证明不同株型棉花品系在光合效率、干物质的积累与分配、经济产量以及早熟性等方面均存在着较大的差异。棉花株型的遗传解析及其调控是提高产量,适应机械化需求的高效技术途径,棉花株型育种是棉花遗传改良的重要目标之一。果节长短是棉花株型重要的决定因素之一,是机械化采收的关键影响性状。短果节有利于成熟期集中和机械化采收。因此,棉花短果节的分子解析具有重要的研究意义和生产实践意义。
但是,由于短果节是多基因遗传,表型往往表现连续变异,基因效应难以定量。采用常规育种技术对这个衣分控制位点进行人为选择需要很长年限,且由于短果节表型表现为隐性、易受环境影响,每次回交转育后仅凭表型判断难以确保此衣分控制基因在转育和改良过程中没有丢失,从而需要耗费大量的棉田、人力和财力。因此,如何通过分子标记辅助选择方法稳定可靠又快速简便的进行短果节材料的选育和改良成为本发明的关键核心。
分子标记直接从DNA水平反映出核苷酸序列的差异,它不受发育阶段、环境因素以及基因是否表达的影响,具有数量非常丰富,遗传稳定等特点。目前,随着分子生物学的飞速发展,分子标记检测技术已经发展出几十种技术可用于分子标记的筛选,比较常用的有RFLP、RAPD、ISSR、SSR、SCAR、STS、AFLP和SNP等,随着分子标记技术的不断发展和应用,目前,国内外已经越来越多的将各种分子标记技术应用在作物育种材料的分子标记辅助选择育种中。SNP(Single nucleotide polymorphisms)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。在所有真核生物基因组中均存在并且含量非常丰富,具有多态性丰富、稳定性好、位点专一性、共显性等特点。
发明内容
本发明所要解决的一个技术问题是如何解决现有技术中鉴定棉花短果节长短性状所需时间长、消耗大和/或准确性差的问题。
为了解决以上技术问题,本发明提供了以下技术方案:
A1、TagSNP-6400827在鉴定或辅助鉴定棉花果节长短中的应用;所述TagSNP-6400827是棉花基因组的一个SNP位点,所述TagSNP-6400827是位于棉花第D01号染色体上SEQ ID No.1(在SEQ ID No.1中用W表示A或T)的第147位核苷酸,其为A或T。
A2、检测棉花基因组中TagSNP-6400827的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定棉花果节长短产品中的应用;所述TagSNP-6400827是棉花基因组的一个SNP位点,TagSNP-6400827是位于棉花第D01号染色体上SEQ ID No.1的第147位核苷酸,其为A或T。
上述应用中,SEQ ID No.1由167个核苷酸组成,SEQ ID No.1对应于棉花第D01号染色体第6400681-6400847位,SEQ ID No.1的第147位核苷酸为A或T。
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