[发明专利]基于m6A相关的IncRNA网络胃癌预后的模型构建及临床应用有效
| 申请号： | 202010945972.3 | 申请日： | 2020-09-10 |
| 公开（公告）号： | CN112048559B | 公开（公告）日： | 2023-10-17 |
| 发明（设计）人： | 马斌 | 申请（专利权）人： | 辽宁省肿瘤医院 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;G16B5/00;G16B20/00;C12N15/113 |
| 代理公司： | 沈阳亚泰专利商标代理有限公司 21107 | 代理人： | 马维骏 |
| 地址： | 110042 辽*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 基于 m6a 相关 incrna 网络 胃癌 预后 模型 构建 临床 应用 | ||
1.一种胃癌预后标记物，其特征在于，所述预后胃癌标记物为AL049840.3、AC008770.3、AL355312.3、AC108693.2、BACE1-AS、AP001528.1、AP001033.2、AC092574.1、AC010719.1、AC009090.3和SAMD12-AS1 11种IncRNA组合。
2.基于权利要求1所述标记物的预后风险模型公式为：其中，Expi表示每个lncRNA表达，βi表示每个lncRNA系数。
3.如权利1所述胃癌预后标记物和权利要求2所述的预后风险模型公式的临床应用如下：
1)作为评估预后危险度的分子标记物的应用；
2)用于评估胃癌预后危险度。
4.一种预测胃癌预后的模型，其特征在于，含有主要与胃癌的预后有关的11种IncRNA为：AL049840.3、AC008770.3、AL355312.3、AC108693.2、BACE1-AS、AP001528.1、AP001033.2、AC092574.1、AC010719.1、AC009090.3、SAMD12-AS1。
5.如权利要求4所述的预测胃癌预后的模型的建立方法，其特征在于，具体包括以下步骤：
(1)从癌症基因组图谱TCGA数据库下载RNA转录组数据集和相应的临床信息；
(2)使用皮尔逊系数法筛选出与m6A调控基因相关的13个lncRNA；
(3)利用单因素COX比例风险回归模型，计算每个LncRNA与患者生存的关系，筛选其中与患者生存相关的11个LncRNA；
(4)利用LASSOCox回归模型，在训练集中建立LncRNA预后模型，计算获得LncRNA预后预测模型中包含的11个LncRNA的权重系数，通过COX比例风险回归模型，计算每个患者不良预后的风险指数，根据其中位数，将患者划分为高危和低危两组，判断患者不良预后风险，同时运用受试者工作特征曲线ROC分析评估其准确性。
6.一种检测所述胃癌预后的模型的方法，其特征在于，具体包括RNA的获取，LncRNA筛选，模型的构建和风险评分的计算。
7.如权利要求6所述的检测所述胃癌预后的模型的方法，其特征在于，所述的筛选为首先是筛选与m6A相关的基因，然后在筛选后的基因中对比其在肿瘤组织与正常组织之间是否有显著的差异表达。
8.如权利要求6所述的检测所述胃癌预后的模型的方法，其特征在于，所述的LncRNA是筛选获得的相关的11个m6A相关LncRNA。
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